芸薹属A基因组单一基因微卫星分布及其通用性研究
作者单位：沈阳农业大学园艺学院 华中农业大学
会议名称：《中国园艺学会2010年学术年会》
会议日期：2010年
学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090202[农学-蔬菜学]
基 金：国家自然科学基金项目(30771468) 教育部高等学校博士学科点专项科研基金项目(20092103110006)
关 键 词：芸薹属 单一基因 简单重复序列（SSR） 单一基因微卫星（UGMS） 通用性
摘 要：单一基因微卫星(UGMS)标记有别于EST-SSR标记,具有染色体位点单一的优点,适用于分析和评价基因的变异。一套高效的、可转移的、通用UGMS核心引物的筛选对于芸薹属A基因组种质资源的鉴定、杂种优势群划分、遗传多样性分析、品种DNA指纹数据库构建等研究具有重要的价值。以2008年11月从NCBI下载的182703条芸薹属A基因组EST序列为来源,利用Seqclean,ESTtrimmerRepeatmasker和CAP3去除冗余后解析出单一基因。利用MISA搜索包含SSR的单一基因,即