子囊菌较担子菌具有更快的进化速率和更高的物种多样性
作者单位：真菌与地衣系统学重点实验室中国科学院微生物研究所 中国科学院研究生院 北京自然历史博物馆
会议名称：《2010年中国菌物学会学术年会》
会议日期：2010年
学科分类：0710[理学-生物学] 1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 07[理学] 071005[理学-微生物学] 10[医学]
基 金：Supported by the National Natural Science Foundation of China(Grant 30570008 and 30770012) the Chinese Academy of Sciences(Grant KSCX2-YW-Z-041)
关 键 词：进化速率 氨基酸替代 核苷酸替代 真菌进化 物种多样性 奠基者效应
摘 要：有许多研究表明在一些进化分支或有机体之间存在着核苷酸或氨基酸替代速率差异。越来越多的证据表明种群内的中性分子突变与物种多样化相关。超过98%的陆生真菌属于子囊菌门和担子菌门,而且前者的物种多样性明显多于后者。我们获得了地衣型真菌红脐鳞的21种蛋白质编码基因序列,并应用这些及GenBank中的相关序列进行了随后的分析。我们建立了三组矩阵:a)13种真菌,包括105种蛋白质编码基因;b)9种真菌,包括21种蛋白质编码基因;c)299种真菌的nu LSU rDNA序列。应用这些数据,我们检测了子囊菌门与担子菌门以及子囊菌内部主要纲之间的基因替代速率。蛋白质数据和nu LSUrDNA数据分析都显示子囊菌的基因替代速率显著快于担子菌;而且在子囊菌内部,物种丰富的粪壳菌纲进化速率最快,物种数量较少的锤舌菌纲进化最慢。这些结果意味着子囊菌的快速进化不是得益于互惠共生、生态条件、无性繁殖、代谢速率或者短世代时间,而可能是由奠基者效应引起的。这是物种数量与进化速率相关的又一证据,与奠基者效应是导致物种丰富的分支进化速率较快的主要原因的假说相吻合。