第二代小RNA测序技术挖掘蜜蜂microRNA
作者单位：浙江大学动物科学学院 中国科学院基因组信息与科学重点实验室中科院北京基因组研究所 浙江大学沃森基因组科学研究院
会议名称：《第四届中国畜牧科技论坛》
会议日期：2009年
学科分类：090504[农学-特种经济动物饲养（含：蚕、蜂等）] 0905[农学-畜牧学] 09[农学]
关 键 词：microRNAs 蜜蜂 SOLiD测序 靶基因
摘 要：microRNAs（miRNA）在转录后水平调控基因表达,从而在许多生理和病理过程中起重要作用。蜜蜂是社会性物种研究的一个关键模型,理论上讲,其复杂的社会行为可以用基因表达的改变来解释,而miRNA很可能参与其中。我们用SOLiD测序系统对蜜蜂不同发育阶段的小RNA构成的一个混合文库进行了测序,以从中识别出蜜蜂miRNA。结果获得了36 796 459条小RNA读出序列,并从中识别出713个新候选miRNA,其中192个新候选miRNA在其他昆虫中具有同源序列。我们进行了靶基因预测并分析它们的功能,结果显示大多数蜜蜂miRNA的靶基因在糖、氨基酸、脂肪和能量的代谢中起作用。本研究获得的结果可作为蜜蜂发育过程以及一些人们感兴趣的现象如级型分化现象中miRNA调控网络研究的基础。