Quaking基因在胶质瘤中表达特征和临床意义的探究

作     者：陈鹤文 

作者单位：中国人民解放军医学院 

学位级别：硕士

导师姓名：马晓东

授予年度：2022年

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

主      题：胶质瘤 Quaking 预后 胶质瘤相关巨噬细胞 miRNA 

摘      要：目的:通过生物学分析的方法探究Quaking(QKI)基因在胶质瘤中的表达特征及临床意义,探究QKI在胶质瘤中潜在的生物学机制。方法:1.利用TCGA(The Cancer Genome Atlas)数据库中695例胶质瘤患者的临床和高通量测序数据,分析QKI在不同WHO(World Health Organization,WHO)等级的胶质瘤中表达差异情况,并使用CGGA(Chinese Glioma Genome Atlas)数据库中325＿seq数据集进行验证。2.分析QKI在不同异柠檬酸脱氢酶(Isocitrate Dehydrogenase,IDH)突变状态胶质瘤患者中的表达差异情况及对IDH突变型胶质瘤的诊断水平。3.分析QKI在不同染色体1p19q共缺失状态胶质瘤患者中的表达差异情况及对染色体1p19q共缺失型胶质瘤的诊断水平。4.分析QKI表达水平与胶质瘤患者发病年龄的关系。5.分析QKI表达水平与胶质瘤患者生存的关系。单因素和多因素Cox分析QKI对胶质瘤预后的影响作用。6.分析QKI在胶质瘤中的基因变异情况,及QKI基因变异对胶质瘤生存的影响。7.利用蛋白互作网络探索QKI共表达蛋白的生物学功能与胶质瘤的关系。8.分析QKI在TCGA胶质瘤中的差异基因分析和功能富集。9.分析QKI在胶质瘤中与胶质瘤相关巨噬细胞(glioma-associated microglia and macrophages,GAMs)的表达关系。10.使用免疫荧光双标染色探究QKI在GAMs中的表达情况。11.分析QKI在胶质瘤中与多种免疫检查点的表达关系。结果:*** mRNA在WHOⅣ级胶质瘤中表达水平显著降低。2.与IDH野生型胶质瘤相比,QKI mRNA在IDH突变型胶质瘤中表达水平显著增高。并且可以作为IDH突变型胶质瘤的诊断分子。*** mRNA在染色体1p19q缺失型胶质瘤中显著高于染色体1p19q非缺失型胶质瘤的QKI mRNA表达水平,且诊断染色体1p19q缺失型胶质瘤有一定的准确性。*** mRNA的表达水平与胶质瘤患者的发病年龄有关。低年龄组(年龄≤41岁)胶质瘤患者的QKI mRNA表达水平显著高于高年龄组(年龄41岁)胶质瘤患者的QKI mRNA表达水平。*** mRNA高表达组患者的总生存期大于QKI mRNA低表达患者的总生存期。多因素Cox回归分析显示QKI高表达可以作为胶质瘤的独立预后影响因子。***在胶质母细胞瘤(Glioblastoma,GBM)中基因变异的频率较高。且QKI基因变异胶质瘤患者的总生存期和疾病特异性生存期低于QKI基因非变异组。***蛋白互作网络分析显示,QKI蛋白与CAMK2蛋白家族、PTBP蛋白家族、MAPK蛋白家族等密切相关。***在胶质瘤中基因差异主要富集在细胞免疫反应、肿瘤坏死因子信号通路等方面。***的表达水平与胶质瘤中M2型GAMs呈显著负相关。***在瘤旁组织、WHOⅡ级GAMs中的表达水平较高。***在胶质瘤中的表达与CTLA4、LAG3等免疫检查点显著负相关。结论:在本研究中,QKI被鉴定为与胶质瘤诊断和预后相关的抑癌基因,提高QKI表达水平有望成为胶质瘤治疗的有效方案。