TMEM121基因在肝细胞癌患者中的表达及潜在作用的研究

作     者：刘洪 

作者单位：桂林医学院 

学位级别：硕士

导师姓名：周军媚

授予年度：2023年

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

主      题：TMEM121基因 肝细胞癌 生物信息学 信号通路 

摘      要：目的:TMEM121(Transmembrane Protein 121)是跨膜蛋白基因家族的成员之一,该家族的许多成员参与肿瘤的发生及发展过程,然而TMEM121基因在肝细胞癌中的作用,目前尚未见报道。本文旨在结合生物信息学分析,探讨肝细胞癌组织中TMEM121的表达情况及潜在作用。方法:采用TIMER2.0数据库,在转录水平分析TMEM121泛癌组织中的表达情况以及其表达与肿瘤免疫浸润细胞之间的相关性,进一步利用Sanger Box分析TMEM121在肝细胞癌中的表达情况,Kaplan-Meier Plotter数据库分析TMEM121表达水平与肝细胞癌患者总生存期(Overall Survival,OS)及无进展生存期(Progression-Free Survival,PFS)的相关性。Linked Omics数据库分析TMEM121表达水平与肝细胞癌患者临床病理特征的关系及共表达基因,Metascape数据库对其与TMEM121基因共表达TOP500基因进行进行GO(Gene Ontology,GO)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析。收集55对肝细胞癌组织和癌旁组织的临床样本及病历信息,采用免疫组织化学分析TMEM121蛋白在肝细胞癌组织和癌旁组织的表达,并分析其表达水平与临床病理参数的关系。结果:生物信息学分析发现TMEM121在多种肿瘤与癌旁中表达具有差异性(P0.05),在肝细胞癌患者中TMEM121相对于癌旁组织明显下调(P0.05),生存分析显示TMEM121在肝细胞癌患者中低表达提示患者预后不良,其共表达基因参与了多条与肝细胞癌发生发展有关的信号通路,并且其表达水平与多种免疫细胞浸润相关。采用临床样本进行免疫组化分析,结果显示,TMEM121蛋白质主要表达在肝癌细胞的细胞质,在癌和癌旁中组织具有表达差异。结论:生物信息学分析TMEM121在多种肿瘤及癌旁组织和肝细胞癌组织及癌旁组织的表达均具有差异,TMEM121表达水平与多种免疫细胞浸润相关,在肝细胞癌患者中低表达与患者预后不良相关。与TMEM121共表达基因可能参与了多条与肝细胞癌发生发展有关的信号通路,因此,TMEM121可能是肝细胞癌患者的预后的一个生物标志物,本文初步探讨了TMEM121在肝细胞癌的表达以及潜在作用,为进一步的功能研究提供理论基础。