基于生物信息学分析PRAME对子宫内膜癌发生发展的影响

作     者：吴茜林 

作者单位：河北医科大学 

学位级别：硕士

导师姓名：代聪伟

授予年度：2023年

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

主      题：黑色素瘤优先表达抗原 子宫内膜癌 生物信息学分析 

摘      要：目的:本文通过应用生物信息学分析技术,研究黑色素瘤优先表达抗原(preferentially expressed antigen in melanoma,PRAME)基因表达与子宫内膜癌发生发展的关系及其潜在的作用机制,探讨其在子宫内膜癌预后判断中的价值以及能否成为潜在的药物作用靶点。方法:1.利用USCSXena Shiny进行泛癌分析,了解PRAME在恶性肿瘤中的差异表达情况。2.通过分析人类蛋白质图谱(human protein atlas,HPA)数据库深入了解PRAME在子宫内膜癌及癌旁组织中的表达情况。3.通过对癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库及基因组织表达(Genotype-Tissue Expression,GTEx)数据库进行综合生物信息学分析,了解PRAME差异性表达对子宫内膜发生发展的意义。4.对PRAME进行生存分析,并采用单因素及多因素Cox分析探究与子宫内膜癌相关的预后因素。5.应用基因本体论(Gene Ontology,GO)及京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析与PRAME表达相关的差异基因,深入探究PRAME在子宫内膜癌中的潜在作用机制。6.应用肿瘤免疫估计资源(Tumor Immune Estimation Resource,TIMER)分析探究PRAME表达水平与子宫内膜癌免疫浸润之间的关联。结果:1.在22种肿瘤中PRAME呈现显著高表达,PRAME的异常表达显著影响了不同类型癌症患者的生存及预后。***和GTEx数据库联合显示,PRAME在子宫内膜癌中高表达,该基因可以起到识别肿瘤的作用。3.生存分析显示,PRAME低表达可能对患者的预后产生一定程度的不良影响。然而综合单因素和多因素分析表明,PRAME不能作为独立的预后因素。4.子宫内膜癌的深肌层浸润与PRAME的低表达水平密切相关,而与更年期状态、临床分期无关。5.在子宫内膜癌中,PRAME的表达水平与自然杀伤细胞、嗜酸性粒细胞的浸润程度呈正相关,与T细胞、B细胞、树突状细胞、细胞毒细胞、巨噬细胞的浸润程度呈负相关。***分析表明,PRAME相关基因集中在经典补体激活途径、不同免疫细胞介导的体液免疫应答、蛋白活化级联等细胞生物过程。KEGG富集分析显示,PRAME相关基因可能作用于趋化因子信号通路、钙离子信号通路、视黄醇代谢相关信号通路上。结论:1.与正常子宫内膜组织相比,在子宫内膜癌组织中PRAME呈高表达。2.以中位值为标准,PRAME低表达可能对患者的预后产生一定程度的不良影响,或可作为评估子宫内膜癌患者预后状况的一项指标。***表达上调与经典补体激活途径、免疫细胞介导的体液免疫应答及视黄醇代谢信号通路相关,PRAME通过对免疫细胞的浸润的影响,可能参与了子宫内膜癌的免疫调节,有望成为子宫内膜癌新的治疗靶点。