基于全外测序（WES）探讨NACT对晚期卵巢高级别浆液性癌患者基因组的影响及其意义

作     者：智佳 

作者单位：河北医科大学 

学位级别：硕士

导师姓名：张军

授予年度：2023年

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

主      题：高级别浆液性卵巢癌 新辅助化疗 全外显子测序 基因突变 体系突变 

摘      要：目的:运用全外显子测序(WES)技术探索新辅助化疗(NACT)对卵巢高级别浆液性癌患者基因组的影响,分析NACT利弊,指导精准治疗的深入开展,改善患者预后。方法:本研究共纳入8例于我院行腹腔镜探查后接受新辅助化疗并完成中间性肿瘤细胞减灭术的卵巢高级别浆液性癌患者,新辅助化疗前后的福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)组织块均取自河北医科大学第四医院病理科。通过对成对的FFPE标本切片,提取肿瘤组织DNA,继而进行文库构建和上机测序,通过对比新辅助化疗前后组织的基因组状态,从而鉴定出新辅助化疗后标本中体细胞的突变基因。结果:1.在8例卵巢高级别浆液性癌患者的8组新辅助化疗前后研究标本中,出现最多的突变方式是SNV(单核苷酸变异),发生的碱基替换集中在CT/GA,导致的突变类型以错义突变最多见。2.研究中突变频率较高的基因多达20余个,其中以TTN基因突变最多见,突变频率为62%,其次是FOCAD(50%)、SYNE1(50%)、FAT2(38%)、MUC4(38%)。3.研究中突变基因涉及的信号通路有6条,所占比例分别为NOTCH(6/8)、RTK-RAS(6/8)、WNT(6/8)、Hippo(5/8)、PI3K(4/8)、MYC(3/8)、Cell-Cycle(1/8),其中涉及频率最高的基因是FAT2(3/8),所在信号通路为Hippo。结论:1.本研究通过比较NACT治疗前后肿瘤组织的基因组状态,结合文献筛选出了NACT治疗后的四个突变次数较多且较有意义的基因,分别为FOCAD、SYNE1、MUC4、FAT2。2.通过查阅文献了解到FOCAD、SYNE1基因突变可能会导致HGSOC患者NACT后不良预后,而MUC4、FAT2基因突变可能会改善HGSOC患者NACT的预后。3.本研究所纳入的样本量较少,并且上述四个突变基因所致结果存在冲突,因此无法基于此来衡量NACT应用于临床的好与坏。4.本研究为深入研究NACT对晚期HGSOC患者的影响提供了方向,为指导NACT的临床应用打下了理论基础。