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鄂尔多斯地区猫杯状病毒感染流行情况调查及VP1基因同源性分析

鄂尔多斯地区猫杯状病毒感染流行情况调查及VP1基因同源性分析

作     者:樊培新 

作者单位:内蒙古农业大学 

学位级别:硕士

导师姓名:王文龙

授予年度:2023年

学科分类:090601[农学-基础兽医学] 09[农学] 0906[农学-兽医学] 

主      题:猫上呼吸道疾病 猫杯状病毒 流行病学调查 VP1基因 

摘      要:猫杯状病毒(Feline calicivirus;FCV)属于杯状病毒科,水疮性病毒属,为单股正链RNA病毒,是猫科类动物呼吸道感染常见病原之一,呈世界性分布,能引起猫科类动物咳嗽、打喷嚏、眼分泌物增多、口腔溃疡、跛行等多种症状,严重的甚至会死亡。当前我国较为缺乏对FCV的了解与流行病学调查,与国外研究相差甚远,因此,很有必要开展相关的流行病学调查研究工作。本研究在2019年7月至2022年12月期间,收集鄂尔多斯部分地区的宠物医院疑似猫上呼吸道传染病感染病例237例,对感染病例利用小型荧光定量PCR鉴定是否猫杯状病毒,并对其进行病原感染情况分析、关联因素分析和转归情况分析。之后RT-PCR扩增VP1基因,与国内外参考毒株VP1基因进行遗传进化树与同源性分析。结果显示,收集的237例上呼吸道感染病例中,发现感染猫杯状病毒105例,感染率占比44.30%。在患病猫只中,症状分别有打喷嚏、流鼻涕、眼分泌物增多、口腔溃疡、发热等。感染猫只年龄分布从一月龄至八岁,且感染病例性别未见显著性差异。另外,有69例感染病例为单纯感染,36例伴有除杯状病毒外其他呼吸道病原感染。本文分析的毒株与其他参考毒株的相似性在72.4%~79.1%,FCV-eerduosi1与KT000003.1株相似性最低,为73.5%;与KM111557.1株相似性最高,为79.1%;FCV-eerduosi2与DQ424892.1株相似性最低,为72.4%;与KM111557.1株相似性最高,为77.6%。遗传演化树分析显示,FCV-eerduosi1和FCV-eerduosi2与KJ495728.1、KF557763.1、KM111557.1和KX815169.1位于同一分支遗传关系较近。本文主要研究鄂尔多斯市部分地区猫上呼吸道感染中感染杯状病毒的情况以及感染毒株同源性与遗传进化树分析,为猫杯状病毒的疫苗防治以及该疾病的流行与传播做出参考,减少该疾病的广泛流行,从而减少损失。

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