基于28S rDNA和线粒体全基因组澜沧江水系鲃亚科和鲌亚科寄生指环虫属单殖吸虫的系统学研究

作     者：邓晋琪 

作者单位：云南师范大学 

学位级别：硕士

导师姓名：范丽仙

授予年度：2023年

学科分类：0906[农学-兽医学] 09[农学] 

主      题：指环虫属 鲃亚科 鲌亚科 28S rDNA 线粒体全基因组 系统学 

摘      要：作为鱼类和水生四足类常见的寄生虫,单殖吸虫因其宿主特异性,成为研究寄生虫与宿主协同进化的良好材料。指环虫属是单殖吸虫纲的超级属,全球记录1000余种。开展指环虫属的系统学研究,对防控鱼类吸虫病和理解指环虫-鱼类宿主协同进化机制具有重要意义。本研究综合形态学特征、28S rDNA序列和线粒体基因组特征,对采自澜沧江水系鲃亚科和鲌亚科鱼类的指环虫属单殖吸虫进行了系统学研究,为后续深入研究指环虫属系统进化提供新科学数据。1、本研究于澜沧江水系景洪流域段、勐腊、补远江流域段和万峰湖等水域共采集鱼类标本1目1科4属4种163尾,对从鲃亚科、鲌亚科鱼类鳃上获得7种指环虫属单殖吸虫,其中已记录种6种,新种1种,分别是寄生于异斑小鲃Puntius ticto的小鲃指环虫Dactylogyrus puntius,寄生于短吻鱼Sikukia gudgeri的云南指环虫***,寄生于大鳞高须鱼Hypsibarbus vernayi的补远江指环虫新种*** ***.,寄生于?条Hemiculter leucisculus的棒形指环虫***、红鲌指环虫***、带状指环虫***和潛伏指环虫***。2、检测分析了小鲃指环虫和棒形指环虫线粒体全基因组特征:(1)小鲃指环虫和棒形指环虫都具有36个基因,缺失atp8基因;(2)小鲃指环虫有3种类型的终止密码子TAA、TAG、T,1种类型的起始密码子ATG;棒形指环虫有3种类型的终止密码子TAA、TAG、T,4种类型的起始密码子ATG、ATA、GTG、ATT;(3)小鲃指环虫的trn S1基因缺失DHU,trn L1基因和trn H基因缺失T-Ψ-C环,棒形指环虫的trn S1基因缺失DHU,trn P基因缺失T-Ψ-C环。3、对小鲃指环虫和棒形指环虫的线粒体全基因组及Gen Bank数据库中现有的47种单殖吸虫线粒体全基因组比较分析表明:(1)单殖吸虫的AT含量均明显高于GC含量;(2)单殖吸虫的相关同义密码子(RSCU)都具有较高的密码子偏好性,同时单殖吸虫更偏向于使用AT含量高的碱基的密码子;(3)cox1基因在单殖吸虫中较为保守。4、基于28S rDNA、cox1部分序列及线粒体基因组的系统发育关系研究结果表明:(1)指环虫属是单系;(2)指环虫属的早期宿主为野鲮亚科鱼类;(3)多钩亚纲是并系,寡钩亚纲是单系,多钩亚纲中的指环虫科、锚首虫科和锚盘虫科为并系;(4)Tetraonchidea与三代虫目亲缘关系不密切,与指环虫目,分室目亲缘关系更近。