肠道菌群高通量测序在新生儿坏死性小肠结肠炎诊疗中的价值

作     者：王英豪 

作者单位：安徽医科大学 

学位级别：硕士

导师姓名：戴立英

授予年度：2022年

学科分类：1002[医学-临床医学] 100202[医学-儿科学] 10[医学] 

主      题：坏死性小肠结肠炎 高通量测序 厚壁菌门 变形菌门 双歧杆菌 

摘      要：目的:坏死性小肠结肠炎（necrotizing enterocolitis,NEC）是影响早产儿肠道的最常见疾病,常见于早产儿,病死率高,约20-30%。存活NEC患儿也会有诸多并发症如短肠综合征,肠外营养相关的胆汁淤积和肝功能障碍、营养不良、代谢性骨病等。目前关于NEC发病机制仍未完全了解。本研究旨在通过对新生儿坏死性小肠结肠炎患儿肠道菌群进行高通量测序,了解其变化特点为NEC诊疗提供理论依据。方法:以2020.年1月到2021年7月在安徽医科大学附属省儿童医院住院的早产儿（胎龄37周）为研究对象,分为非NEC组（对照组）和NEC组（实验组）,后者根据治疗前后分为两个亚组:NEC组（治疗前）和NEC组（治疗后）。实验组（治疗前）在诊断NEC后24小时内采集粪便标本,同时采集对照组粪便标本,实验组（治疗后）在临床症状明显好转,达全量喂养时采集粪便标本。通过高通量测序技术对患儿粪便进行基因测序,分析粪便标本的菌群多样性以及明确细菌种类。结果:实验组患儿治疗前后及对照组各收集1份粪便样本,最终共收集66份粪便样本,其中实验组44份,对照组22份。实验组患儿平均出生胎龄（35±2）w,剖宫产率41%（9/22）,母乳喂养率36%（8/22）,男婴45%（10/22）,女婴56%（12/22）,出生体重（2274±236）g;对照组患儿平均出生胎龄（35±3）w,剖宫产率41%（9/22）,母乳喂养率36%（8/22）,男婴45%（10/22）,女婴56%（12/22）,出生体重（2358±227）g。实验组（治疗前）和对照组肠道菌群多样性指数:Shannon指数分别为0.93±0.50及1.10±0.34;Sobs指数分别为19.36±7.08及21.96±4.76;Simpson指数分别为0.51±0.26及0.46±0.16;Chao值分别为22.16±7.62及25.44±6.97;提示实验组（治疗前）和对照组肠道菌群丰富度及均匀度无统计学差异（p0.05）。实验组治疗前后肠道菌群多样性指数:Shannon指数分别为0.93±0.50及0.91±0.51;Sobs指数分别为19.36±7.08及21.23±6.43;Simpson指数分别为0.51±0.26及0.58±0.25;Chao值分别为22.16±7.62及24.25±7.10;提示实验组治疗前后肠道菌群丰富度及均匀度无统计学差异（p0.05）。实验组（治疗前）和对照组肠道菌群种类构成方面具有明显差异:实验组以肠球菌（占40%）,厚壁菌门（占21%）,变形菌门（占23%）,双歧杆菌（占10%）为主;对照组以大肠杆菌（占42%）,肠球菌（占25%）,双歧杆菌（30%）,厚壁菌门（占2%）为主。实验组治疗前后肠道菌群种类构成方面具有明显差异:实验组（治疗前）以肠球菌（占40%）,厚壁菌门（占21%）,变形杆门（占23%）,双歧杆菌（占10%）为主;实验组（治疗后）以大肠杆菌（占28%）,肠球菌（占21%）,双歧杆菌（占28%）,厚壁菌门（占8%）为主,变形菌门（约占5%）,两组之间克雷伯杆菌所占比例无明显差异。结论:本研究结果表明实验组（治疗前）和对照组、实验组治疗前后肠道菌群种类有显著差异,表明NEC患儿发病时肠道菌群中厚壁菌门及变形菌门丰度增加,且双歧杆菌丰度降低。