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高通量测序技术在湖南汝城县地中海贫血基因突变类型分析中的应用

高通量测序技术在湖南汝城县地中海贫血基因突变类型分析中的应用

作     者:陆国荣 

作者单位:南华大学 

学位级别:硕士

导师姓名:雷冬竹

授予年度:2021年

学科分类:1002[医学-临床医学] 10[医学] 

主      题:高通量测序技术 地中海贫血 湖南汝城县 基因分析 

摘      要:目的:了解湖南汝城人群地中海贫血(简称地贫)基因携带率、基因突变类型及构成比,为汝城县地贫防控提供数据参考。方法:收集2017年1月~2019年12月在湖南省汝城县各医院进行检查的人群7674例,通过血常规五分类和血红蛋白电泳进行地贫初筛,筛查阳性者,进一步通过高通量测序技术进行地贫基因分析,统计地贫在该地区的携带率、基因突变类型及构成比。对夫妻携带同型地贫可能孕育中重型地贫患儿的孕妇进行地贫基因产前诊断。结果:1.7674例样本中共检出615例地贫,地贫携带率为8.01%。其中α-地贫365例、β-地贫223例、αβ复合型地贫27例,占比分别为4.76%、2.91%、0.35%。另检出3例异常血红蛋白,占比0.04%。2.共检出26种地贫基因突变类型,包括17种常见和9种罕见变异类型。α-地贫共检出11种基因变异类型,包括4种缺失型突变和7种非缺失型突变,以缺失型突变--/αα为主,占比69.32%。β-地贫共检出13种突变类型,包括12种点突变和1种缺失型突变,以Codons41/42(-TTCT)和IVS-Ⅱ-654(CT)突变为主,占比分别为34.53%、31.39%。αβ复合型地贫共涉及17种组合类型,以-α/αα复合Codons41/42(-TTCT)为最常见的组合类型,占比23.53%。3.共有32例孕妇接受了地贫产前基因检查,共检出中重型地贫10例,包括Hb H病3例,重型α-地贫5例,中重型β-地贫2例。结论:1.湖南汝城县地贫基因携带率为8.01%,其中α-地贫、β-地贫、αβ复合型地贫的基因携带率分别为4.76%、2.91%、0.35%。2.湖南汝城县地贫基因类型多样,共检出26种基因突变类型,包括17种常见和9种罕见变异类型。α-地贫最常见的为缺失型突变,其基因型主要为--/αα、-α/αα、-α/αα;β-地贫最常见的为点突变型,其基因型主要为:Codons41/42(-TTCT)、IVS-Ⅱ-654(CT)、-28(AG)。另检出3例异常血红蛋白。3.在地贫高发区,利用高通量测序技术进行地贫基因检测,可提高罕见地贫的检出率,有效避免漏检。

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