广西地区非综合征性聋家系耳聋基因全外显子组测序研究

作     者：冯梦龙 

作者单位：广西中医药大学 

学位级别：硕士

导师姓名：唐凤珠

授予年度：2021年

学科分类：1002[医学-临床医学] 100213[医学-耳鼻咽喉科学] 10[医学] 

主      题：基因突变 非综合征性聋 基因芯片 全外显子组测序 

摘      要：目的:通过对耳聋基因芯片检测结果为隐性遗传基因杂合突变或阴性的广西地区非综合征性聋家系成员进行全外显子组测序分析,寻找罕见致聋基因或突变位点,甚至发现新的致聋基因或突变位点,为针对性地设计广西地区耳聋基因筛查方案提供更为详实的数据,提高耳聋基因检测效率,达到精准医疗的目的。方法:对2019年5月-2020年12月在我院就诊的广西地区耳聋患者行病史分析、听力学检查、影像学检查和十五项遗传性耳聋基因芯片检测,收集10个耳聋患者基因芯片检测结果为隐性遗传基因杂合突变或阴性的广西地区非综合征性聋家系,对家系成员的DNA样本行全外显子组测序,并对所检测出的突变位点在家系成员中进行Sanger测序验证。结果:1.家系1,耳聋患者均为极重度感音神经性耳聋,父母双方听力正常,家系成员耳聋基因芯片检测均为阴性,进一步行全外显子组测序发现,家系父母分别携带MYO15A基因c.4143-1GA和c.7396-1GA杂合突变,先证者和其弟弟均为MYO15A基因c.4143-1GA/c.7396-1GA复合杂合突变,根据美国医学遗传学与基因组学学会（the Amercian College of Medical Genetics and Genomics,ACMG）制定的变异解读标准,上述突变均为致病突变,经查数据库和文献未见致病性报道。2.家系2,先证者为双耳极重度感音神经性耳聋,其弟弟为双耳重度感音神经性耳聋,患儿父母听力正常。家系成员耳聋基因芯片检测均为阴性,对家系成员行全外显子组测序研究,发现先证者父母分别携带TRIOBP基因c.5185-2AG和c.3299CA杂合突变,先证者和其弟弟均为TRIOBP基因c.5185-2AG/c.3299CA复合杂合突变,根据ACMG变异解读标准,TRIOBP基因c.5185-2AG和c.3299CA,分别为致病突变和可能致病突变,上述突变经查数据库和文献未见致病性报道。3.家系3,耳聋患者均为极重度感音神经性耳聋,父母双方听力正常。家系成员耳聋基因芯片检测均为阴性,对家系成员行全外显子组测序研究,发现先证者父母分别携带MYO15A基因c.5638GA和c.6733GA杂合突变,先证者和其妹妹、弟弟均为MYO15A基因c.5638GA/c.6733GA复合杂合突变,根据ACMG变异解读标准,MYO15A基因c.5638GA和c.6733GA均为可能致病突变,上述突变经查数据库和文献未见致病性报道。4.家系8/9/10,父母双方听力均正常,耳聋患者均为极重度感音神经性耳聋,家系成员耳聋基因芯片检测结果均为阴性,进一步对家系成员行全外显子组测序研究,均未发现任何可疑致病突变位点。5.在8个耳聋基因芯片初筛结果为阴性的家系（共17名耳聋患者）中发现遗传性耳聋患者11名（64.7%,11/17）,其中,遗传性耳聋患者中携带新发致病突变有7人（63.6%,7/11）;3个家系（共6名耳聋患者）携带SLC26A4基因致病突变,其中,携带SLC26A4基因c.919-2AG突变的患者4人（66.7%,4/6）。结论:1.MYO15A基因c.4143-1GA、7396-1GA、c.5638GA和c.6733GA均为新发致病突变位点,其突变是导致非综合征性聋的重要遗传病因。2.TRIOBP基因是罕见致聋基因,本研究新发现的c.5185-2AG和c.3299CA致病突变位点丰富了该基因的突变谱。3.在广西地区常见耳聋基因芯片初筛为阴性的非综合征性聋患者中,可能存在罕见基因或突变位点,甚至新的致病基因或突变位点。