基于4D Label-free定量蛋白组学技术筛选急性主动脉夹层早期诊断标志物
作者单位:新疆医科大学
学位级别:硕士
导师姓名:马翔
授予年度:2020年
学科分类:1002[医学-临床医学] 100201[医学-内科学(含:心血管病、血液病、呼吸系病、消化系病、内分泌与代谢病、肾病、风湿病、传染病)] 10[医学]
摘 要:目的:基于4D Label-free定量蛋白组学技术筛选急性主动脉夹层早期诊断标志物,实现急性主动脉夹层的早期快速诊断。方法:采用病例一对照研究方法,选取Stanford A型急性主动脉夹层患者10例,行冠脉搭桥术的冠心病患者10例。术中留取升主动脉组织标本,首先用4D Label-free定量蛋白组学技术,分析两组患者升主动组织标本的蛋白质组谱的变化并完成蛋白质鉴定与定量,筛选显著差异表达蛋白,进一步数据库搜库,对差异蛋白行生物信息学分析。根据生物信息学分析结果,选取与急性主动脉夹层发生发展有关的7个显著差异蛋白,最后应用受试者工作特征曲线分析方法,分析7个差异蛋白对急性主动脉夹层的诊断价值。结果:1.质谱分析及蛋白鉴定,一共鉴定到3985个蛋白,其中3350个蛋白可定量。2.通过4D Label-free技术计算两组间可定量蛋白的差异表达量,差异倍数≥1.5倍的显著高表达蛋白有139个,差异倍数≤0.67的显著低表达蛋白有108个。3.对显著差异表达蛋白行生物信息学分析,结果显示差异蛋白的功能主要涉及到炎症反应、细胞外基质的降解、细胞代谢、应激反应以及TGF-β信号通路等生物学过程。4.7个差异蛋白对AAD诊断价值的比较结果示,除了核心蛋白聚糖外其余6个差异蛋白AUC均0.70,有较高的灵敏性、特异性,可作为急性主动脉夹层早期诊断候选标志物。结论:本实验应用高通量4D Label-free定量蛋白组学技术筛查显著差异蛋白,初步明确了LTBP1、TGFB1、SAA1等6个蛋白可作为急性主动脉夹层候早期诊断选候选标志物。