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黄淮南片小麦淀粉糊化特性全基因组关联分析

黄淮南片小麦淀粉糊化特性全基因组关联分析

作     者:薛辉 

作者单位:河南农业大学 

学位级别:硕士

导师姓名:詹克慧;刘冬成

授予年度:2019年

学科分类:09[农学] 0901[农学-作物学] 

主      题:小麦 RVA SNP芯片 关联分析 等位变异 

摘      要:淀粉对小麦的产量和加工品质有显著影响,淀粉糊化特性是预测小麦淀粉品质的最有效指标,且与面条等食品品质关系紧密。因此,近年来小麦淀粉糊化特性对小麦品质的影响越来越受到人们的关注。本研究选用近十年来黄淮南片麦区种植或者正在参加审定试验的小麦材料198份,经过2年3个地点的表型鉴定,使用小麦660k芯片与表型进行关联分析,解析小麦淀粉糊化特性的遗传特性,为小麦品质改良提供参考。主要研究结果如下:1该地区小麦的淀粉糊化参数在试验品种间的变异并不丰富,但整体很好。同时我们也得到了一些糊化特性较好的材料,如偃麦864和郑麦366,其峰值粘度超过3400CP,稀澥值超过1500CP,可能具有较好的品质潜力,可以作为小麦品质改良的供体。2 198份材料可以分为2个亚群,亚群1有82个品种(系),亚群2包含116份材料。3使用660k芯片与表型数据进行关联分析,共检测到105个与糊化特性相关联的SNP位点,分布在21条染色体上。单个位点的表型变异贡献率(R)为9.45%4.98%。在染色体2A、3B和7A上检测到较多的位点,且与多个糊化参数都关联,这些位点所在染色体可能富含控制淀粉糊化特性的基因,需要进一步研究。此外,与PV、TV、FV和PT同时关联的位点有24个,1个SNP位点与SB、Pte和HD同时关联。4在关联到的105个SNP位点中,33个SNP位点比较稳定,在至少3个环境下被关联到,23个标记位点同时与多个糊化参数关联。其中SNP标记AX-108839983、AX-109325234、AX-109873883、AX-110017082、AX-111596290、AX-86170796等标记不仅重现性好,对糊化参数表型性状的解释率也较高(15.22%0.00%),且与多个糊化参数同时关联,应重点研究。5筛选到21个对淀粉糊化特性有正向作用的优势等位变异,可以用于分子标记辅助育种。

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