安徽地方猪LDLR基因多态、表达及其与肉质的相关性分析

作     者：付坤 

作者单位：安徽农业大学 

学位级别：硕士

导师姓名：殷宗俊;丁月云

授予年度：2016年

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

主      题：猪 LDLR基因 血脂性状 胴体性状 肉质性状 相关性分析 

摘      要：本研究以安徽地方猪种(圩猪、安庆六白猪、皖南黑猪和霍寿黑猪)为试验材料,以在动物体内胆固醇代谢过程中发挥重要功能的低密度脂蛋白受体(LDLR)基因为候选基因,采用PCR-SSCP技术检测LDLR基因部分区段的遗传变异,运用SPSS程序最小二乘分析法检测该遗传变异与血脂性状相关指标的相关性,并检测突变位点对LDLR基因在肌肉和肝脏组织表达的遗传效应;运用双变量相关性分析检测肝脏和背最长肌组织LDLR基因的表达水平对胴体及肉质性状的影响。研究影响血脂性状相关功能基因的构造、遗传与变异、表达及其与相关性状的相关性,选择可能会存在新的分子标记的多态性位点,以探讨利用该基因作为分子标记运用于猪遗传育种的可行性,为安徽地方猪种血脂及肉质性状的遗传改良提供科学根据。试验结果如下:(1)LDLR基因组织表达谱分析:LDLR基因的表达水平在肝脏中最高,脾脏上的表达水平最低,组织中从高到低的表达依次是肝脏、背肌、背脂、心脏、肾、脑、肺、脾。该试验验证了LDLR基因在肝脏中的高表达,为后续试验的开展提供了科学依据。(2)圩猪、安庆六白、皖南黑猪和霍寿黑猪LDLR基因第三内含子12088、12093碱基处发生A→G突变(g.12088AG)和C→T突变(g.12093CT)。通过群体遗传学分析表明:在g.12088AG突变位点中检测到AA、AG、GG三种基因型;在g.12093CT突变位点中检测到CC、CT、TT三种基因型,经过χ2适合性检验,被测猪群的基因型频率和基因频率都处于Hardy-Weinberg平衡状态,g.12088AG与g.12093CT两突变位点是连锁突变位点。(3)圩猪LDLR基因g.12088AG/g.12093CT突变位点与血液中胆固醇含量的相关性分析表明:在此两个位点的突变对血液总胆固醇、高密度和低密度脂蛋白胆固醇含量显著影响。(4)圩猪LDLR基因在不同基因型个体的肝脏和肌肉中的表达分析表明:不同基因型的圩猪LDLR在肝脏上的转录水平有显著差异,LDLR mRNA在AA/CC型圩猪肝脏中的表达显著高于GG/TT型(PG/g.12093CT位点可以作为圩猪血脂性状候选遗传标记,以应用于血脂性状的改良。猪LDLR基因可能在血脂性状和胴体、肉质性状的形成过程中发挥重要作用。