春谷子农艺和品质性状与Waxy基因多态性分析

作     者：孙宇燕 

作者单位：内蒙古农业大学 

学位级别：硕士

导师姓名：郭世华;杨自力

授予年度：2014年

学科分类：09[农学] 0901[农学-作物学] 

主      题：谷子 Waxy基因 农艺性状 品质性状 多态性 

摘      要：Waxy基因编码颗粒结合型淀粉合成酶(granule bound starch syntheses, GBSS), GBSS控制直链淀粉的合成。Waxy基因变异降低谷子直链淀粉含量或不合成直链淀粉。 本试验以53份不同地区谷子品种(品系)为材料,分析其农艺性状和品质性状的变异,并对其中15份材料Waxy基因多态性进行多序列比对,主要结果如下： (1)供试53份材料的农艺性状变异幅度为0.07-0.28,其中生育期的变异系数最小为0.07,穗粒重的变异系数最大为0.28。穗长、节数／叶片数、穗粗、穗重和千粒重与产量呈极显著正相关,株高与产量呈显著正相关。采用类平均法以阈值0.8354,将供试53份材料聚九大类。第三类产量较高,为467Kg/亩,包括09-220、09-221、赤10-321、昭农21、jui-108、鑫谷10号、沁谷三、红谷子、赤谷4号和大白毛等10份材料。 (2)53份谷子材料胶稠度变幅为83-175mm,其中锦谷5号、赤谷16等6份材料的胶稠度大于150mm,33份材料的胶稠度大于115mm。51份材料的碱消值均大于3,属于中等偏低糊化温度。糯质、低直链淀粉含量、非糯类型的频率分别为15%、60%和25%,其中金谷子、黄粘谷(00001534)等10份材料的直链淀粉含量在14%-16%之间。 (3)引物ex1/TSI2R、M5/M9、ex2int2/ex4在赤谷16号、利谷21等15份材料中均分别扩增出约250bp-500bp.2000bp和1000bp的谱带：引物ex1/ex2在利谷21、赤谷4号、A2不育度低和A2-1不育系等4份材料中均未扩增出谱带,在其余11份材料中均扩增出约1200bp的谱带;M2/R4在丰田501和金丰谷中未扩增出条带,在其余13份材料中均扩增出约1500bp的谱带。 (4)与KF372879的waxy基因序列比对,共检测到365个SNPs变异。不同材料之间相比,总SNPs最多的为赤谷6号、赤谷16和公矮5号,分别为37、38和37,SNPs较少的有赤谷4号和利谷21,均为16。外显子上SNPs较多的为大白毛、A2-1不育系、丰田501、公矮5号和赤谷5号,分别为6、5、5、5和5个。结果发现糯性材料共有的变异位点12处,供试两份糯性材料的变异位点10处。