海洋细菌新属种的分类鉴定及解磷菌解磷特性的分析
作者单位:国家海洋局第一海洋研究所
学位级别:硕士
导师姓名:孙修勤;曲凌云
授予年度:2011年
学科分类:0710[理学-生物学] 1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 07[理学] 071005[理学-微生物学] 10[医学]
主 题:海参养殖池 盐场 海洋细菌 新种 新属 分类 鉴定 16S rDNA DNA-DNA杂交 解磷能力
摘 要:海洋细菌分布于海洋的不同位置,如海水、海洋底泥、海洋动植物体表及内部等。海洋环境条件的特异性、多样性赋予海洋细菌以物种、生理、代谢和生态功能上的多样性。海洋细菌多样性可为人类提供种类繁多、结构新颖、化学组成复杂和生理活性特异的海洋天然产品,是药物、保健食品和生物材料的巨大宝库。因此,对不同环境中的海洋细菌进行研究,可以进一步认识、开发和利用这些环境中的细节资源,具有理论和实践双重意义。 本研究采用微生物生理生化技术和分子生物学技术,对从海洋环境中获得的细菌进行分离并采用16S rDNA测序技术对疑似新属、种的菌株进行深入的生理生化和分子生物学鉴定,共发现3株新菌种和1个新属。对其中1株解磷菌进行了解磷特性研究,具体结果如下: 1.海洋新属新菌Sunxiuqinia elliptica gen. nov., sp. nov. DQHS4T的分类鉴定: 菌株DQHS4T分离自即墨海参养殖池的底泥样本中,16S rDNA序列分析表明其与亲缘关系最近的Prolixibacter bellariivorans F2T序列相似性为89.6%,且DQHS4T与已知菌株均存在较大差异,不能归类到任何已知的属种,结合各种形态及生理生化特征可知,该菌株为拟杆菌门(Phylum Bacteroidetes)新属新种,DQHS4T指定为模式菌株,建议命名为Sunxiuqinia elliptica gen. nov., sp. nov.。菌株在三个不同国家的菌种保藏中心的保藏号分别为NCCB 100301T、CGMCC 1.9156T及LMG 25367T。 2.海洋新菌Cohaesibacter marisflavi sp. nov. DQHS21T的分类鉴定: 菌株DQHS21T分离自即墨海参养殖池的底泥样本中, 16S rDNA序列分析结果显示,菌株DQHS21T亲缘关系最近的黏着杆菌属(Cohaesibacter)菌株*** CL-GR15序列相似性为96.1%,形态及生理生化特征分析表明菌株DQHS21T符合黏着杆菌属(Cohaesibacter)的基本特征,而该菌株与*** CL-GR15在形态、生理生化特征上的明显差异及BOX-PCR指纹图谱分析的结果表明菌株为一新种,DQHS21T指定为模式菌株,建议命名为Cohaesibacter marisflavi sp. nov. ,已保藏在荷兰细菌保藏中心及中国普通微生物保藏管理中心,保藏号分别为NCCB 100300T及CGMCC 1.9157T。 3. 1株中度嗜盐海洋新菌的分类鉴定及解磷能力分析 菌株YCWA18分离自即墨市大桥盐场的底泥样本中,为革兰氏阴性好氧菌,与亲缘关系最近的模式菌株Kushneria sinocarnis Z35的16S rDNA序列相似性为98.57 %,并结合菌株的形态及生理生化特征初步鉴定为Kushneria属的菌株。YCWA18具有较强的解磷能力,在最适生长条件下培养时,菌株的Ca3(PO4)2分解能力最高可达283.16μg/ml,卵磷脂分解能力最高为47.52μg/ml。