灵昆鸡CRBP4、OCX-32、VLDLR和CTSD基因与产蛋性状的关联分析

作     者：张丽萍 

作者单位：浙江师范大学 

学位级别：硕士

导师姓名：卢立志

授予年度：2016年

学科分类：0905[农学-畜牧学] 09[农学] 

主      题：灵昆鸡 CRBP4基因 OCX-32基因 VLDLR基因 CTSD基因 SNP 产蛋性状 关联分析 

摘      要：本研究对F3、F4两世代灵昆鸡的300日龄产蛋量、500日龄产蛋量和300日龄蛋品质共11个性状进行了分析;并选择与产蛋性状密切相关的细胞视黄醇结合蛋白（Cellular retionol-binding protein 4, CRBP4）、蛋壳基质蛋白（Ovocalyxin-32, OCX-32）、极低密度脂蛋白受体（Very low density lipoprotein receptor, VLDLR）、溶酶体组织蛋白酶（Cathepsin D, CTSD）为研究对象,通过DNA直接测序法检测其单核苷酸多态性位点（Single nucleotide polymorphism site, SNPs）;并分析灵昆鸡CRBP4、OCX-32、VLDLR和CTSD基因多态性与产蛋性状的相关性,寻找灵昆鸡产蛋性状分子标记辅助育种的候选基因,为灵昆鸡选育工作提供理论依据。得到了如下结果：1.对F3、F4两世代灵昆鸡的300日龄产蛋量和500日龄产蛋量进行了统计,对300日龄蛋品质性状进行了测定,比较两世代产蛋性状发现,300日龄产蛋量和蛋黄比率存在显著差异（P0.05）,蛋壳厚度、蛋黄颜色、哈氏单位存在极显著差异（P0.01）,其他性状差异不显著。2.对F3、F4两世代灵昆鸡的产蛋性状分别进行了相关性分析,结果发现在两个世代中,300日龄产蛋量与500日龄产蛋量呈极显著正相关（P0.01）;蛋壳强度和蛋壳厚度呈极显著正相关（P0.01）：哈氏单位和蛋白高度呈极显著正相关（P0.01）;蛋黄重与蛋黄比率呈极显著正相关（P0.01）。3.共检测了12个多态位点：CRBP4的3个多态位点A337C、G2727A、A2847G, OCX-32的3个多态位点G6566A、A6612G、A6760T,VLDLR的1个多态位点C13444T, CTSD的5个多态位点T2614C、C9445T、C9457T、C9475T、 T11028C。其中C13444T、C9457T、T11028C位点偏离了Hardy- Weinberg平衡状态,其余9个位点均处于Hardy- Weinberg平衡状态(P0.051。4. CRBP4基因第2、5外显子SNPs:最小二乘法分析表明,A337C位点AA基因型和AC基因型个体300日龄产蛋量显著高于CC基因型（P0.05）。G2727A位点和A2847G位点,GG基因型蛋重显著高于AA基因型（P0.05）,GG基因型对蛋形指数的影响显著高于AA基因型(P0.051;GG基因型对蛋白高度的影响显著高于AA基因型（P0.05）。5. OCX-32基因第5外显子SNPs-最小二乘法分析表明,A6566G位点AA基因型个体蛋白高度显著高于GG基因型(P0.051。A6612G位点和A6760T位点,GG基因型个体的蛋黄重显著高于AG基因型（P0.05）。6. VLDLR基因的C13444T位点：最小二乘法分析表明,C13444T位点对哈氏单位、蛋黄重、蛋黄比例显著相关（P0.05）;在哈氏单位方面,ZTW型个体均值显著高于ZCW型个体均值（P0.05）;在蛋黄重和蛋黄比率方面,ZCW型个体均值显著高于ZTW型（P0.05）。7. CTSD基因第3、7、9外显子SNPs：最小二乘法分析表明,T2614C位点CC型和CT型在蛋白高度上显著高于TT型（P0.05）;TT基因型哈氏单位显著高于CT基因型（P0.05）。C9445T位点和C9475T位点对500日龄产蛋量和蛋重有显著影响（P0.05）,CC基因型个体均值显著高于CT基因型（P0.05）。C9457T位点CC基因型蛋重显著高于TT基因型（P0.05）。T11028C位点CT基因型蛋白高度显著高于TT基因型（P0.05）。