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中国汉族人群特应性皮炎易感位点相关性研究

中国汉族人群特应性皮炎易感位点相关性研究

作     者:程芳 

作者单位:安徽医科大学 

学位级别:硕士

导师姓名:肖风丽

授予年度:2013年

学科分类:0710[理学-生物学] 1002[医学-临床医学] 07[理学] 071007[理学-遗传学] 10[医学] 100206[医学-皮肤病与性病学] 

主      题:特应性皮炎 遗传学 全基因组关联分析 单核苷酸多态性 临床亚型 

摘      要:研究背景:特应性皮炎(atopic dermatitis,AD)是一种常见的瘙痒性、慢性复发性炎症性皮肤病,具有产生高IgE倾向,易伴发哮喘、过敏性鼻炎,多见于儿童和青少年,严重影响儿童身心健康。目前其发病机制还不清楚,可能是遗传与环境相互作用的结果。近年来,欧美和日本人群的多项AD的全基因组关联分析(Genome-wide association studies,GWAS)与AD GWAS的meta分析研究揭示了AD的多个易感位点。不同种族其遗传易感性是不同的,这些易感位点与中国汉族AD人群的关联性还不清楚,在不同人群中验证AD易感位点的重要性是不容忽视的。 目的:在中国汉族AD患者中验证欧美和日本人群GWAS报道的10个AD易感位点(包括提示易感位点),并进一步分析这些易感位点与AD相关表型的关联性。 方法:选择2,205例特应性皮炎病例和2,116例种族匹配的正常对照,应用Sequenom MassArrayTM质谱阵列技术对我们选择的17个SNPs进行基因分型。相关实验结果用PLINK1.07以及SPSS13.0软件进行分析处理。 结果:由于SNPs rs7637099和rs6461923分型不符合Hardy–Weinberg平衡(P-hwe0.05),所以未进一步分析。(1)经过Bonferroni校正后,余下的15个SNPs的等位基因和基因型频率在病例组与正常对照组间差异均无统计学(PBonferroni0.05);(2)早发型AD组与晚发型AD组相比:rs878860C等位基因频率在早发型AD组明显高于晚发型AD组(62.3%vs.57.9%, P=0.042, OR=1.20),并且rs878860基因型分布在两组之间有显著性差异(P=0.042);(3)AD伴IgE升高组与IgE正常组相比:rs2164983C等位基因频率在IgE升高组中明显高于IgE正常组(90.3%vs.86.3%, P=0.022, OR=1.49),并且rs2164983基因型分布在两组之间有显著性差异(P=0.015);(4)家族异位史阳性组与家族异位史阴性组相比:rs7927894T等位基因频率在家族异位史阳性组中明显高于家族异位史阴性组(19.4%vs.16.7%,P=0.031, OR=1.201),并且rs7927894基因型分布在两组之间有显著差异(p=0.031);(5)AD伴哮喘及过敏性鼻炎组与“单纯型AD相比:rs952559T等位基因频率在AD伴哮喘及过敏性鼻炎组中明显高于单纯型AD组(64.9%vs.58.6%, P=0.047, OR=1.31),并且rs952559基因型分布在两组之间有显著性差异(P=0.046);(6)AD伴毛周角化症组与AD不伴毛周角化症组相比:rs6780220T等位基因频率在AD伴毛周角化症组中明显高于AD不伴毛周角化症组(61.4%vs.56.4%, P=0.024, OR=1.23),并且rs6780220基因型分布在两组之间有显著性差异(P=0.042)。 结论:(1)欧美和日本人群新发现的10个AD GWAS易感位点可能与中国汉族AD的发病不具有相关性;(2)11p15.4区域的rs878860可能与AD的早发有关;(3)11p13.5区域的rs7927894可能与AD伴家族异位史具有相关性;(4)8p21.13区域的rs952559可能与AD伴有哮喘和过敏性鼻炎相关;(5)3p21.33区域的rs6780220可能与AD伴毛周角化症存在一定的关联性;(6)19p13.2区域的rs2164983可能与AD伴高血清IgE相关。以上结论提示AD不同临床亚型可能有不同的遗传异质性,这些发现将为我们对AD遗传发病机制拓展新的视野,有助于我们更好的了解AD的发病机理和临床评估。

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