染色体1q22区域遗传变异影响胃癌易感性的生物学机制研究

作     者：颜财旺 高志颖 黄童童 靳光付 Caiwang Yan;Zhiying Gao;Tongtong Huang;Guangfu Jin

作者机构：南京医科大学公共卫生学院流行病学系 南京医科大学附属淮安第一医院消化内科 

出 版 物：《中国肿瘤临床》 (Chinese Journal of Clinical Oncology)

年 卷 期：2020年第47卷第21期

页      面：1108-1114页

核心收录：

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：国家重点研发计划“重大慢性非传染性疾病防控研究”重点专项课题（编号：2016YFC1302703） 国家自然科学基金面上项目（编号：81872702） 中国博士后科学基金委员会项目（编号：2019TQ0157,2020M671546）资助~~ 

主　　题：胃癌 1q22区域 易感性 GBAP1 代谢 

摘      要：目的:探索染色体1q22区域易感基因在胃癌发生中的作用和机制。方法:基于genotype-tissue expression(GTEx)数据库,鉴定候选易感基因;通过人群样本进行基因差异表达分析,并通过细胞和动物实验探究易感基因在胃癌发生中的作用;通过全转录组测序探究候选易感基因在胃癌发生中参与的下游通路和机制。结果:表达数量性状基因座(expression quantitative trait loci,eQTL)分析证实rs760077基因型与THBS3、GBA和GBAP1基因的表达水平均显著相关(P值分别为1.20×10-21,1.80×10-4和3.49×10-17)。差异表达分析和功能学实验证实GBAP1在胃癌组织中呈现高表达状态,并且敲低GBAP1后能够显著抑制胃癌细胞增殖能力。全转录组测序表明GBAP1能够影响PHGDH、PSAT1和PSPH基因的表达水平并参与包括甘氨酸、丝氨酸、苏氨酸代谢和一碳代谢在内的多种代谢通路。结论:本研究证实1q22区域的遗传变异可以通过调控促癌基因GBAP1的表达,影响氨基酸合成代谢通路关键酶基因PHGDH、PSAT1和PSPH的表达,从而促进胃癌的发生。