湖南益阳黑茶中桔青霉线粒体全基因组序列测定及分析
Sequencing and Analysis of the Complete Mitochondrial Genome of Penicillium Citrinum in Hunan Yiyang Dark Tea作者机构:湖南农业大学食品科学技术学院湖南长沙410128 湖南城市学院材料与化学工程学院湖南益阳413000 湖南省食品质量监督检验研究院湖南长沙410111
出 版 物:《茶叶科学》 (Journal of Tea Science)
年 卷 期:2020年第40卷第6期
页 面:830-844页
核心收录:
学科分类:0710[理学-生物学] 1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 07[理学] 09[农学] 090203[农学-茶学] 071005[理学-微生物学] 0902[农学-园艺学] 10[医学]
基 金:湖南省黑茶金花重点实验室资助项目(湘科规财8号) 湖南省重点研发计划资助项目(2018NK2036) 安化黑茶非遗传承湖南省社会科学普及基地(湘社普6号)
摘 要:对黑茶中分离的一株桔青霉线粒体基因序列进行测定与分析,并探究其与近缘种微生物的系统发育关系。结果表明,桔青霉线粒体基因组是一条全长27537 bp的环状DNA分子,共编码42个基因(15个蛋白质编码基因,2个rRNA,24个tRNA以及1个独立的ORF),基因组碱基构成为:A(36.17%)、T(37.06%)、C(11.82%)、G(14.95%)。15个蛋白质编码基因均采用典型的ATG作为起始密码子、TAA或TAG作为终止密码子,基因排列顺序与已报道的青霉属物种相似,在进化上较为保守。蛋白质编码基因编码频率较高的氨基酸分别为Leu、Ile、Ser和Phe;RSCU频率最高的4个密码子依次是UUA、AUA、UUU和GGU。24个tRNA基因存在30处G-U错配,均可形成典型三叶草结构。系统发育分析结果表明,桔青霉分类地位上关系最密切是Penicillium ShG4C,其次是Penicillium polonicum与Penicillium nordicum。