诺如病毒基因分型研究进展
Progress on genotyping of norovirus作者机构:北京市疾病预防控制中心北京市预防医学研究中心传染病地方病控制所100013 首都医科大学公共卫生学院北京100069
出 版 物:《中华流行病学杂志》 (Chinese Journal of Epidemiology)
年 卷 期:2020年第41卷第11期
页 面:1927-1932页
学科分类:0710[理学-生物学] 1007[医学-药学(可授医学、理学学位)] 100705[医学-微生物与生化药学] 1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学]
基 金:首都卫生发展科研专项(2020-2-1011) 北京市疾病预防控制中心/北京市预防医学研究中心科研培育专项(2020-BJYJ-21,2019-BJYJ-10)
摘 要:诺如病毒是引起急性胃肠炎的主要病原体之一,极易突变和重组,型别众多。研究早期采用VP1区氨基酸序列对诺如病毒进行分型及鉴定。由于处在或接近聚合酶和衣壳区的重叠区为重组发生的热点区域,因此国际上提出使用聚合酶和衣壳区的双区域分型系统。目前基于2 s标准的双区域分型方法,聚合酶区可分为10个基因组及76种基因型,包括2个暂定基因组及16种暂定基因型,VP1可分为12个基因组及53种基因型,包括2个暂定基因组及5种暂定基因型。暂定基因组和基因型有待进一步型别鉴定和基因组划分。本文对诺如病毒分子特征、不同分型方法的原理、序列扩增方法、在线分型工具及最新的基因分型研究进展进行综述。