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双链DNA解链温度的特征自组织预测方法(英文)

Prediction melting temperature of DNA duplex by self-organization feature map(SOFM)

作     者:石晓龙 李新 潘林强 刘向荣 刘文斌 Shi Xiaolong;Li Xin;Pan Linqiang;Liu Xiangrong;Liu Wenbing

作者机构:华中科技大学控制科学与工程系湖北武汉430074 武汉大学第一附属医院湖北武汉430060 

出 版 物:《计算机与应用化学》 (Computers and Applied Chemistry)

年 卷 期:2006年第23卷第6期

页      面:515-518页

核心收录:

学科分类:07[理学] 0703[理学-化学] 

基  金:The supported by the Chinese National Natural Science Foundation(No.60274026 60373089) 

主  题:解链温度 双链DNA 特征自组织 

摘      要:解链温度是目前评价DNA序列热力学稳定性的一个主要的参数,目前,生物工程中常用的各种预测方法都存在某些序列的误差偏大的缺点,因此难以满足像DNA计算这种大量DNA序列进行各种生化反应的计算过程的要求。本文以DNA序列的邻近法参数为基础,根据DNA序列热稳定性特点提出了DNA序列的编码方案,并建立了基于特征自组织网络的解链温度的预测模型。计算结果表明,DNA序列的解链温度的误差可以达到±5℃的范围。

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