DNA条形码技术在河北省鼠疫疫源地常见蚤种鉴定中的应用

作     者：兰晓宇 鲁亮 候芝林 杜国义 史献明 崔耀仁 刘冠纯 陈永明 康东梅 郑楠 任兴宇 闫东 LAN Xiao-yu;LU Liang;HOU Zhi-lin;DU Guo-yi;SHI Xian-ming;CUI Yao-ren;LIU Guan-chun;CHEN Yong-ming;KANG Dong-mei;ZHENG Nan;REN Xing-yu;YAN Dong

作者机构：河北省鼠疫防治所流行病科河北张家口075000 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206 

出 版 物：《中国媒介生物学及控制杂志》 (Chinese Journal of Vector Biology and Control)

年 卷 期：2020年第31卷第6期

页      面：662-666页

学科分类：1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

基　　金：河北省医学科学研究重点课题(20180955) 

主　　题：蚤类 DNA条形码技术 细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ基因 细胞色素C氧化酶亚基Ⅱ基因 种类鉴定 

摘      要：目的以河北省常见鼠疫媒介蚤为研究对象,使用线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因和细胞色素C氧化酶亚基Ⅱ(COⅡ)基因对其进行分子生物学鉴定,建立河北省常见蚤种的DNA条形码数据库。方法 2018年6-8月在张家口市康保牧场采集鼠体寄生蚤及洞干蚤,2018年9-10月在张家口崇礼区采集鼠体寄生蚤,经形态学鉴定后,选取标本形态完整的不同蚤种提取总DNA,扩增线粒体COⅠ和COⅡ基因片段,并进行测序,将测序结果与GenBank中蚤类序列进行BLAST同源性比对,利用邻接法构建COⅠ和COⅡ基因序列的系统进化树。结果选取的16份蚤类样本均能通过PCR扩增出特异性COⅠ和COⅡ基因条带,其中13份样本COⅠ测序成功,12份样本COⅡ测序成功。COⅠ基因的分子进化树结果中,12份样本与形态学鉴定结果一致,1份样本与形态学有差异。COⅡ基因的分子进化树结果与形态学鉴定全部一致。结论 COⅠ和COⅡ基因均可作为DNA条形编码基因对河北省鼠疫疫源地的常见蚤类进行物种鉴定,利用2个基因同时进行蚤种鉴定提高了鉴定的成功率,所积累数据为以后的蚤类分子鉴定技术提供了可利用的数据库。