南瓜生长素响应因子(ARF)基因家族的全基因组分析及表达分析

作     者：袁敬平 申长卫 陈碧华 李新峥 YUAN Jingping;SHEN Changwei;CHEN Bihua;LI Xinzheng

作者机构：河南科技学院园艺园林学院河南新乡453003 河南省园艺植物资源利用与种质创新工程研究中心河南新乡453003 河南科技学院资源与环境学院河南新乡453003 

出 版 物：《植物生理学报》 (Plant Physiology Journal)

年 卷 期：2020年第56卷第11期

页      面：2383-2396页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090202[农学-蔬菜学] 

基　　金：河南科技学院高层次人才引进启动项目(103010620001/015和2017034) 

主　　题：南瓜 生长素响应因子 基因复制 顺式作用元件 

摘      要：为研究南瓜(Cucurbita moschata)生长素响应因子(ARF)基因家族,利用生物信息学工具分析南瓜ARF(CmARF)基因数目、在染色体上的分布、结构以及编码蛋白保守结构、基序、顺式作用元件,并利用实时荧光定量PCR (qRT-PCR)技术分析CmARF的组织表达模式。共鉴定出32个CmARF成员,根据其氨基酸序列的一致性将其分为7个亚族(Ⅰ~Ⅶ),同一亚族的ARF通常表现出相似的基因结构(外显子-内含子分布)和保守结构域。染色体定位分析表明, 32个CmARF在21条染色体中的15条存在不均匀分布;其中16个CmARF形成8个重复的基因对,且都经历了片段复制事件。CmARF在根、茎、子叶和真叶中的表达特征表明,其具有组织特异性。顺式作用元件分析表明,一些关键CmARF可能参与对脱落酸、茉莉酸甲酯、生长素、水杨酸等的响应。所有CmARF均含有保守的DBD和MR结构域,部分CmARF还含有CTD结构域。CmARF基因的结构与进化时间相关,且CmARF的扩张是由于基因的片段复制事件造成的。本研究为阐明CmARF的功能和作用机理提供理论基础。