藏药翼首草角鲨烯合成酶的生物信息学分析

作     者：何焱 李忠玥 李卿 吕宗友 权红 张磊 兰小中 He Yan;Li Zhongyue;Li Qin;LüZongyou;Quan Hong;Zhang Lei;Lan Xiaozhong

作者机构：西藏农牧学院西南大学药用植物联合研发中心林芝860000 中国人民解放军海军军医大学药学院药用植物学教研室上海200433 中国人民解放军海军军医大学附属长征医院上海200003 

出 版 物：《基因组学与应用生物学》 (Genomics and Applied Biology)

年 卷 期：2020年第39卷第7期

页      面：3139-3150页

核心收录：

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 0710[理学-生物学] 07[理学] 071007[理学-遗传学] 10[医学] 

基　　金：第四次全国中药资源普查西藏自治区(中)藏药资源普查项目(20180611-542229) 西藏农牧学院研究生创新计划项目(YJS2017-09)共同资助。 

主　　题：藏药 翼首草 生物信息学 角鲨烯合成酶 

摘      要：翼首草(Pterocephalus hookeri)是西藏地区传统藏药材,目前研究发现其主要药效物质以三萜皂苷及环烯醚萜苷为主。为研究藏药翼首草三萜类化合物下游途径关键酶SQS调控三萜类物质的合成机制,本研究首次利用翼首草转录组数据库筛选出翼首草角鲨烯合酶(PhSQS)基因,采用生物信息学方法对SQS氨基酸的组成、理化性质、疏水/亲水性、蛋白质结构及其功能域等进行了预测与分析。通过同源性比对,构建了SQS蛋白的系统发育树。研究结果显示PhSQS蛋白序列与烟草、人参、三七同源性较高,PhSQS开放阅读框(ORF)为1251 bp,相对分子量为47 kD,氨基酸残基个数为417,理论等电点为8.38。PhSQS蛋白存在明显的疏水区域和亲水区域。PhSQS蛋白二级结构的主要结构元件是α-螺旋和无规则卷曲,含有SQS蛋白功能结构域。本研究获得的PhSQS基因信息,能够确定PhSQS蛋白具有催化鲨烯的功能,为今后进一步研究藏药翼首草次生代谢调控提供理论依据。