西伯利亚鲟Sox9基因cDNA全长克隆、序列分析及其表达检测

作     者：施志仪 程千千 宋佳坤 轩兴荣 SHI Zhi-yi* ,CHENG Qian-qian,SONG Jia-kun,XUAN Xing-rong (College of Fisheries and Life Science,Shanghai Ocean University,Shanghai 201306,China)

作者机构：上海海洋大学水产与生命科学学院 

出 版 物：《水产学报》 (Journal of Fisheries of China)

年 卷 期：2010年第34卷第5期

页      面：664-672页

核心收录：

学科分类：0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：上海市科委基础重大项目(073205109) 上海市重点学科水生生物学建设项目(S30701) 

主　　题：西伯利亚鲟 Sox9 cDNA全长 cDNA末端快速扩增 表达检测 

摘      要：为了研究Sox9基因在西伯利亚鲟侧线神经发育过程当中所起的调控作用,本研究利用RT-PCR和RACE方法获得了西伯利亚鲟Sox9基因cDNA全长序列,经序列分析表明,所克隆Sox9cDNA全长为1409bp,包括开放阅读框(open reading frame,ORF)1083bp,5′端非翻译区(untranslate dregion,UTR)19bp和3′端非翻译区(untranslate dregion,UTR)307bp。1083bp的ORF共编码360个氨基酸,相对分子质量为41221.7U。序列分析表明,其与施氏鲟的亲缘关系较近,其次是斑马鱼。经实时荧光定量PCR技术对西伯利亚鲟Sox9基因在各组织以及在胚胎发育各时期中的相对表达量检测发现,Sox9在西伯利亚鲟中的表达具明显的组织差异性和时间差异性。其中,在肝,肾,肌肉,胰中的相对表达量较低。然而,大脑组织中的表达量与以上4个组织相比,处于极高水平,达到胰脏中相对表达量8.9倍,达到表达量最低点肾脏中的近21倍。在胚胎发育的不同阶段,Sox9均有表达。在原肠期、神经胚期及视泡形成期,Sox9基因的表达量均较高,特别是在原肠期其表达量达到西伯利亚鲟整个胚胎发育期的最高点,相当于表达量最低点心脏形成期的1.9倍。在神经胚期和视泡形成期,Sox9的相对表达量也相对处于较高水平,仅比原肠期略低,其相对表达量是心脏形成期1.2倍和1.4倍。本研究将为今后深入研究Sox9基因在西伯利亚鲟侧线神经节分化发育、细胞迁移过程中所起的调控作用积累资料。