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金属阳离子对膝沟藻毒素适配体(GO18-T-d)G四联体结构的影响

The Effect of Metal Cations on the G-quadruplex Structure of Gonyautoxin Aptamer(GO18-T-d)

作     者:章琪 刘建平 Zhang Qi;Liu Jian-ping

作者机构:复旦大学生命科学学院上海200438 

出 版 物:《生物化工》 (Biological Chemical Engineering)

年 卷 期:2020年第6卷第5期

页      面:116-117,120页

学科分类:080202[工学-机械电子工程] 08[工学] 0802[工学-机械工程] 

主  题:G四联体 金属离子 圆二色谱 分子动力学模拟 

摘      要:利用圆二色谱技术解析G四联体拓扑结构类型,构建适配体的三维全原子模型,并对适配体GO18-T-d的恒温与升温分子进行动力学模拟,对G四联体在模拟过程中的RMSD波动以及形成G四联体结构的Hoosgteen氢键数目变化进行分析。结果显示,3种离子对适配体GO18-T-d的G四联体结构稳定性贡献度为K+Na+Mg2+,与圆二色色谱实验结果一致,这一发现对于稳定G四联体结构提供了一定的理论指导。

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