环状RNA在小鼠肺发育中的连续表达及功能预测

作     者：付雪 杨洋 沈艳青 周晓光 周晓玉 FU Xue;YANG Yang;SHEN Yan-Qing;ZHOU Xiao-Guang;ZHOU Xiao-Yu

作者机构：南京医科大学附属儿童医院新生儿医疗中心江苏南京210008 

出 版 物：《中国当代儿科杂志》 (Chinese Journal of Contemporary Pediatrics)

年 卷 期：2020年第22卷第10期

页      面：1125-1130页

核心收录：

学科分类：1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 1002[医学-临床医学] 100202[医学-儿科学] 10[医学] 

主　　题：肺发育 环状RNA 生物信息学分析 小鼠 

摘      要：目的探讨环状RNA(circRNA)circ4:150439343|150477468和circ15:73330849|73343359在小鼠肺发育中的连续表达及潜在功能。方法根据肺发育分期,取孕16.5 d(E16.5 d)、孕18.5 d(E18.5 d)及生后2 d(P2 d)胎鼠及新生小鼠的肺组织,利用苏木精-伊红染色观察肺组织形态学;利用qRT-PCR技术检测晚期肺发育过程中circ4:150439343|150477468和circ15:73330849|73343359的表达情况;应用miRanda和TargetScan软件预测circRNA的靶向miRNA,然后对靶基因进行GO和KEGG分析并预测相应circRNA功能。结果在E16.5 d小鼠肺组织切片中观察到Ⅱ型肺泡上皮细胞,且逐渐增多,P2 d时肺泡迅速扩张,间质变薄,肺泡结构逐渐成熟;qRT-PCR结果显示circ4:150439343|150477468相对表达量随时间推移持续上调(P0.05),circ15:73330849|73343359的相对表达量先下调再上调(P0.05);宿主基因功能预测显示circRNA可参与Notch、PI3K-Akt和NF-κB等信号通路。结论circ4:150439343|150477468和circ15:73330849|73343359可通过Notch等信号通路参与肺发育的调控。