荧光聚合酶链反应检测血液标本快速方法的建立及其在ADRB1单核苷酸多态性分型中的应用

作     者：龚如涵 李佳 黄凯峰 GONG Ruhan;LI Jia;HUANG Kaifeng

作者机构：上海交通大学附属第一人民医院检验医学科上海201620 

出 版 物：《诊断学理论与实践》 (Journal of Diagnostics Concepts & Practice)

年 卷 期：2020年第19卷第4期

页      面：402-406页

学科分类：1010[医学-医学技术（可授医学、理学学位）] 10[医学] 

主　　题：荧光聚合酶链反应 直接扩增 ADRB1基因 Sanger测序 

摘      要：目的:建立一种荧光聚合酶链反应(polymerase chain reaction,PCR)检测血液标本的快速方法,并将其应用到ADRB1(1165GC)基因的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)分型检测中。方法:建立可直接利用血液样本进行荧光PCR扩增法,与传统血液样本的基因SNP检测方法不同,本所建立的方法无需进行血液基因组DNA的提取。选取1051份临床乙二胺四乙酸(ethylene diamine tetraacetic acid,EDTA)抗凝全血样本,利用本研究建立的采用血液标本直接扩增的荧光PCR方法,进行ADRB1的SNP分型,并将分型结果与Sanger测序法这一金标准进行对比,评估两者之间的符合率和一致性。结果:本研究建立的方法与传统DNA提取加荧光PCR方法相比,具有较好的扩增性能;与Sanger测序法相比,本研究建立的方法在ADRB1(1165GC)基因SNP分型检测中的总体符合率达到98.98%,Kappa一致性系数达到0.971,具有较高的准确率。结论:与传统方法相比,本研究建立的方法可省略基因组DNA提取步骤,其操作简便、成本较低,且准确率高,适合在基因分型相关临床检验工作中推广和使用。