全基因组数据应用于多克隆副溶血弧菌感染暴发的病原学分析

作     者：张巍巍 李颖 王群 赵林 冯宝立 蒋会婷 郝帅 李清 张颖 马红梅 逄波 Zhang Weiwei;Li Ying;Wang Qun;Zhao Lin;Feng Baoli;Jiang Huiting;Hao Shuai;Li Qing;Zhang Ying;Ma Hongmei;Pang Bo

作者机构：北京市密云区疾病预防控制中心北京101500 北京市顺义区疾病预防控制中心北京101300 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所北京102206 上海交通大学医学院附属仁济医院上海200127 传染病预防控制国家重点实验室北京102206 

出 版 物：《疾病监测》 (Disease Surveillance)

年 卷 期：2020年第35卷第6期

页      面：518-522页

学科分类：1001[医学-基础医学(可授医学、理学学位)] 100103[医学-病原生物学] 10[医学] 

主　　题：副溶血弧菌 暴发 多克隆 基因组重测序 耐热相关溶血素基因 

摘      要：目的应用实时荧光PCR方法和基因组重测序分析等技术对一起副溶血弧菌(VP)导致的腹泻暴发事件进行病原学分析。方法收集暴发事件的病例信息,采集病例样本,使用实时荧光PCR方法筛选常见腹泻致病菌,分离鉴定VP并进行血清型鉴定,检测菌株毒力基因,采用微量肉汤稀释法检测菌株对抗菌药物的敏感性,使用全基因组测序技术进行菌株的遗传学分析。结果9份肛拭子共分离出13株VP菌株,其中O4∶KUT血清型7株(trh-/tdh+),O1∶KUT血清型6株(5株trh+/tdh+,1株trh-/tdh-)。在检测的30种抗菌药物中,所有菌株仅对氨苄西林耐药,对其他29种抗菌药物均敏感。在基于全基因组序列的遗传学分析中,13株VP形成4个相互独立且遗传距离较远的分支,Lineage 1(O4∶KUT、trh-/tdh+,2株)、Lineage 2(O1∶KUT、trh-/tdh-,1株)、Lineage 3(O1∶KUT、trh+/tdh+,5株)和Lineage 4(O4∶KUT、trh-/tdh+,5株),其中3例患者由来源于3个不同遗传分支的VP混合感染。结论本次事件由多血清型、多克隆的VP感染导致,基因组重测序技术在腹泻病暴发的病原分析中有较好的应用前景。