杨树SAMT基因的克隆及生物信息学分析

作     者：董慧霞 孟繁丽 陈军 理永霞 Dong Huixia;Meng Fanli;Chen Jun;Li Yongxia

作者机构：中国林业科学研究院林业新技术研究所北京100091 河南师范大学生命科学学院新乡453007 南京林业大学南方现代林业协同创新中心凤城118100 辽宁省凤城市林业有害生物防治检疫局 

出 版 物：《分子植物育种》 (Molecular Plant Breeding)

年 卷 期：2020年第18卷第15期

页      面：4936-4942页

学科分类：0907[农学-林学] 08[工学] 0829[工学-林业工程] 09[农学] 

基　　金：国家重点研发计划(2017YFD0600102)资助 

主　　题：‘84K杨’ SAMT基因 生物信息学分析 

摘      要：为了揭示水杨酸甲酯转移酶SAMT (Salicylic acid carboxyl methyltransferase)基因在杨树抗溃疡病中的功能。本研究采用RT-PCR技术和pGM-T克隆的方法,获得了‘84K杨’的SAMT基因序列,并对该基因编码的蛋白的理化性质、疏水性、结构域、功能、二级结构及亚细胞定位等进行了生物信息学分析。结果显示:该基因位于细胞质中,属于甲基转移酶7家族,为亲水性蛋白。预测结果为下一步研究该基因在杨树抗溃疡病中的功能提供了帮助,也为其在其他多年生木本植物中的功能研究提供了参考。