结直肠癌肝转移差异表达基因与信号通路分析

作     者：褚雪镭 侯成志 毛昀 李林潞 苏毅馨 陈峥 朱世杰 CHU Xuelei;HOU Chengzhi;MAO Yun;LI Linlu;SU Yixin;CHEN Zheng;ZHU Shijie

作者机构：中国中医科学院望京医院肿瘤科北京100102 北京中医药大学研究生院北京100029 

出 版 物：《中国肿瘤生物治疗杂志》 (Chinese Journal of Cancer Biotherapy)

年 卷 期：2020年第27卷第7期

页      面：787-793页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

基　　金：国家自然科学基金资助项目(No.81573915) 

主　　题：结直肠癌 肝转移 生物信息学 差异表达基因 

摘      要：目的:探讨结直肠癌(colorectal cancer,CRC)肝转移的关键基因和分子机制,为CRC肝转移的治疗提供潜在靶点和生物标志物。方法:基于生物信息学方法从GEO数据库下载CRC肝转移基因表达数据集,筛选差异表达基因(differentially expressed gene,DEG),利用DAVID在线工具对DEG进行GO和KEGG富集分析,构建蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络图,筛选出CRC关键基因并进行预后分析。结果:从183例CRC组织标本和39例CRC肝转移组织标本中筛选出321个DEG,其中上调基因153个、下调基因168个。GO和KEGG富集分析结果显示,DEG的功能主要涉及蛋白质激活级联反应、炎症反应、细胞外基质、血小板脱颗粒、补体与凝血级联反应等。PPI网络图筛选出8个CRC关键基因为ALB、APOB、FGA、F2、APOA1、SERPINC1、FGG和AHSG。生存分析发现,SERPINC1、FGG表达高的患者预后不良(均P0.05)。结论:DEG的生物学功能和信号通路与CRC肝转移的发生发展相关,8个CRC关键基因可能是CRC肝转移治疗的潜在靶点,SERPINC1、FGG可能成为新的预后标志物。