甜瓜circRNA及其蔓枯病抗性靶基因鉴定

作     者：陈静 鲁秀梅 任琴琴 孙亚亭 包卫红 陈雯倩 钱春桃 CHEN Jing;LU Xiumei;REN Qinqin;SUN Yating;BAO Weihong;CHEN Wenqian;QIAN Chuntao

作者机构：南京农业大学园艺学院/作物遗传与种质创新国家重点实验室江苏南京210095 海门市农业科学研究所江苏南通226100 

出 版 物：《南京农业大学学报》 (Journal of Nanjing Agricultural University)

年 卷 期：2020年第43卷第4期

页      面：629-636页

核心收录：

学科分类：09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学] 

基　　金：江苏省农业重大新品种创制项目(PZCZ201718) 

主　　题：甜瓜 蔓枯病 circRNA 靶基因 

摘      要：[目的]本文旨在通过甜瓜接种蔓枯病菌前、后circRNA的研究及靶基因的筛选验证,探究circRNA在甜瓜抗蔓枯病过程中的作用。[方法]利用感病品种‘白皮脆’和抗病材料PI420145,分别在接种前、后取样,构建circRNA文库,通过RNA-Seq、Real-time PCR验证以及基因结构分析,探索circRNA在抗蔓枯病过程中的作用。[结果]12个circRNA文库中共鉴定出3136个circRNA,过滤后共获得1511个circRNA。聚类分析结果表明,circRNA的种类和表达具有品种差异性,且接种蔓枯病菌会引起circRNA的变化。接种蔓枯病菌前、后,在PI420145和‘白皮脆’中分别筛选到4个和3个差异表达的circRNA,其中1个circRNA在2种材料中都有差异表达;对6个靶标基因的结构域分析及RT-qPCR分析结果表明,MELO3C022310、MELO3C002560和MELO3C010763基因与甜瓜蔓枯病抗性相关。[结论]circRNA参与了甜瓜材料PI420145对蔓枯病入侵的防御反应。