基于TCGA数据库分析DLX3基因在结肠癌组织中的表达与临床价值

作     者：毛骏 李海 向晓辉 MAO Jun;LI Hai;XIANG Xiao-hui

作者机构：武警后勤学院天津300309 天津市西青医院消化内科天津300380 

出 版 物：《武警后勤学院学报（医学版）》 (Journal of Logistics University of PAP（Medical Sciences）)

年 卷 期：2020年第29卷第1期

页      面：36-40页

学科分类：1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学] 

主　　题：结肠癌 远端缺失同源盒3 生物信息学 临床价值 

摘      要：【目的】研究远端缺失同源盒3(distal-less homeobox 3,DLX3)基因在结肠癌中的表达情况,探讨DLX3在癌症产生与进展过程中起到的作用和临床意义。【方法】利用癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)得到结肠癌公共数据集,获取DLX3 mRNA表达谱和患者相关的临床信息。利用相关生物信息学方法,分析DLX3在结肠癌中的表达量与临床病理指标的相关性以及对预后的影响。用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)预测DLX3在结肠癌中调控的可能通路。【结果】由TCGA数据库结肠癌数据集分析可得,DLX3在肿瘤组织中呈高表达,表达量与年龄、TNM分期和肿瘤有无转移显著相关(P0.05)。DLX3高表达的患者总体生存期明显低于DLX3低表达的患者(P0.05)。多因素COX回归分析提示DLX3的表达水平、年龄及TNM分期是影响结肠癌患者总体生存期的独立危险因素(P0.05)。DLX3高表达的样本存在Wnt/β-catenin和Kras两个通路基因集的富集(P0.05,FDR0.25)。【结论】DLX3可能在结肠癌的发生发展过程中起到重要作用,具备成为判断结肠癌预后和潜在治疗靶点的临床应用前景。