基于简化基因组测序的中国明对虾3个选育世代遗传多样性分析

作     者：王凤娇 孟宪红 傅强 栾生 隋娟 WANG Fengjiao;MENG Xianhong;FU Qiang;LUAN Sheng;SUI Juan

作者机构：中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室青岛266071 青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室青岛266071 上海海洋大学水产与生命学院上海201306 

出 版 物：《渔业科学进展》 (Progress in Fishery Sciences)

年 卷 期：2020年第41卷第4期

页      面：68-76页

核心收录：

学科分类：090801[农学-水产养殖] 0908[农学-水产] 09[农学] 

基　　金：重点研发计划蓝色粮仓科技创新项目课题(2018YFD0901302) 国家自然科学基金面上项目(41676148) 中国水产科学研究院黄海水产研究所级基本科研业务费项目(20603022017001)共同资助 

主　　题：中国明对虾 选育群体 2b-RAD SNP 遗传多样性 

摘      要：本研究基于简化基因组测序(2b-RAD)技术,对中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)黄海2号 2015~2017年3个连续选育世代(G9~G11)的亲本群体、共649个个体进行了简化基因组测序,并对这3个亲本群体进行了遗传结构和遗传多样性分析。实验在3个选育世代中共获得66985个SNP位点。遗传分析的结果显示,G9~G11平均核苷酸多样性(Pi)分别为0.1439、0.1587和0.1674,平均观测杂合度(Ho)分别为0.1388、0.1515和0.1609,多态信息含量(PIC)分别为0.1241、0.1360和0.1430。G9~G11亲本群体的遗传多样性整体呈现一定的上升趋势,但差异不显著。F检验显示,3个世代总的Fst值为0.0061,G9~G11相邻世代群体间遗传分化程度较弱(G9~G10为0.0029, G10~G11为0.0026),表明相邻世代的遗传距离逐渐减小。3个世代间基因交流充分,基因流为62.91~94.63。本研究表明,人工定向选育工作的推进对中国明对虾选育群体遗传多样性和遗传结构产生了一定的影响:在固定的选择压力下(4%~5%),亲本群体的遗传多样性并无降低的趋势,中国明对虾选育群体遗传分化小,遗传结构趋向稳定。研究结果为进一步制定中国明对虾选育计划提供基础遗传数据和科学的理论指导。