基于小波包变换的冷冻电镜单颗粒重构局域滤波算法
Wavelet packet transform based local filter in cryo-EM single particle reconstruction作者机构:清华大学电子工程系北京100084 清华大学生命科学学院北京100084
出 版 物:《电子显微学报》 (Journal of Chinese Electron Microscopy Society)
年 卷 期:2020年第39卷第3期
页 面:282-287页
学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 08[工学] 080203[工学-机械设计及理论] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0802[工学-机械工程] 0901[农学-作物学] 090102[农学-作物遗传育种]
摘 要:冷冻电镜技术和单颗粒重构算法是获取生物大分子结构的重要方法。对于许多具有局部柔性结构的生物大分子,其重构密度图中柔性区域的重构信噪比会低于其它较为稳定的区域。本文利用小波包变换的时频局部分析能力,定义了一种能够反映重构密度图局域信噪比的指标--小波邻域相关系数,并提出了一种以小波邻域相关系数作为门限准则的局域滤波算法。实验表明该算法在GspD蛋白质重构上有良好效果,能够将分辨率从0.30 nm提高到0.29 nm。