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北京市某区1例人感染H7N9禽流感病毒的HA和NA基因特征分析

Genetic characteristics of hemagglutinin and neuraminidase of avian influenza A (H7N9)virus from one human infection case in a district of Beijing

作     者:吴杨 牛桓彩 庄鹏 李东迅 刘重程 李飒 舒高林 潘阳 WU Yang;NIU Huan-cai;ZHUANG Peng;LI Dong-xun;LIU Zhong-cheng;LI Sa;SHU Gao-lin;PAN Yang

作者机构:北京市昌平区疾病预防控制中心北京102200 北京市疾病预防控制中心北京100013 

出 版 物:《实用预防医学》 (Practical Preventive Medicine)

年 卷 期:2020年第27卷第6期

页      面:667-671页

学科分类:1004[医学-公共卫生与预防医学(可授医学、理学学位)] 100401[医学-流行病与卫生统计学] 10[医学] 

基  金:北京市昌平区卫生科技发展专项(编号:昌卫科2018-2-05) 

主  题:H7N9 禽流感 序列分析 

摘      要:目的了解北京市某区1例人感染H7N9禽流感病毒基因特征,为禽流感病例的早期发现、疫情控制提供参考。方法提取病例临床样本病毒核酸,反转录扩增后进行病毒血凝素基因(hemagglutinin, HA)、神经氨酸酶基因(neuraminidase, NA)序列测定。获得的病毒序列与全球流感共享数据库中H7N9禽流感病毒株进行序列分析,比较该病毒与北京市既往发现株和其他省市毒株同源性,构建系统发育树,并对部分耐药位点和糖基化位点进行分析。结果北京市某区1例H7N9禽流感病毒为低致病性禽流感。HA、NA与北京既往发现的29株毒株氨基酸同源性为97.2%~100%和96.8%~100%,基于系统进化分析与之最为相近的疫苗株为A/Hunan/02650/2016。HA蛋白受体结合位点发生了G186V、Q226L突变,HA和NA的糖基化位点均未发生变化。结论该区出现的H7N9病毒与北京地区既往发现H7N9毒株具有高度同源性,部分氨基酸位点存在变异,但未发生耐药突变。

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