内蒙古呼和浩特地区苹果坏死花叶病毒的检测与遗传多样性研究
Detection and genetic diversity analysis of Apple necrotic mosaic virus in Hohhot, Inner Mongolia作者机构:内蒙古农业大学园艺与植物保护学院呼和浩特010018
出 版 物:《中国果树》 (China Fruits)
年 卷 期:2020年第3期
页 面:39-42,I0004页
学科分类:09[农学] 0902[农学-园艺学] 090201[农学-果树学]
基 金:内蒙古自然科学基金(2019MS03021) 内蒙古农业大学高层次人才科研启动金项目(NDYB2018-3)
摘 要:采用RT-PCR方法对从内蒙古呼和浩特地区采集的29份表现花叶症状的海红果(Malus micromalus Makino)叶片样品进行了苹果坏死花叶病毒(ApNMV)的检测,ApNMV的检出率为100%,说明ApNMV在呼和浩特地区表现花叶症状的海红果上普遍发生。分别克隆并测序了29份海红果样品中ApNMV的全长外壳蛋白(CP)基因,结果表明,29个ApNMV分离物CP基因间核苷酸序列一致性为94.1%~99.8%,与NCBI数据库中其他19个ApNMV分离物全长CP基因核苷酸一致性为86.1%~97.1%。利用ApNMV CP基因的全长序列构建了系统发育树,48个ApNMV分离物共分成5个组,本研究中的29个ApNMV分离物与2个日本分离物LC108995和NC040470聚集在一起,形成组Ⅰ;其余ApNMV分离物分别形成了组Ⅱ~组Ⅴ。