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西瓜幼苗根系发育过程中的蛋白质组分析

Proteomic analysis on root growth and development of watermelon seedlings

作     者:羊杏平 张曼 徐锦华 刘广 姚协丰 李苹芳 YANG Xingping;ZHANG Man;XU Jinhua;LIU Guang;YAO Xiefeng;LI Pingfang

作者机构:江苏省农业科学院蔬菜研究所/江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室江苏南京210014 

出 版 物:《南京农业大学学报》 (Journal of Nanjing Agricultural University)

年 卷 期:2015年第38卷第6期

页      面:901-907页

核心收录:

学科分类:09[农学] 0902[农学-园艺学] 090202[农学-蔬菜学] 

基  金:国家西甜瓜产业技术体系项目(CARS-No.8) 江苏省重大科技支撑计划项目(BE2012323) 江苏省农业科技自主创新资金项目[CX(14)2004] 

主  题:西瓜 根系发育 蛋白质组 表达 

摘      要:[目的]通过对西瓜幼苗根系不同发育时期的蛋白质组变化的研究,从蛋白质表达水平上来揭示西瓜幼苗根系发育的分子机制。[方法]采用双向电泳技术对西瓜根系不同时期的蛋白质组进行比较,对差异蛋白质点进行图谱分析和MALDITOF/TOF质谱鉴定,采用荧光定量PCR技术(RT-q PCR)对候选蛋白基因进行表达验证。[结果]共得到12个差异表达蛋白质点,12个差异蛋白表现不同的表达趋势,其中上调表达4个,下调表达2个,不规则表达6个。经质谱分析,11个蛋白得到鉴定,对鉴定出的蛋白进行功能分析,其中10个蛋白分别涉及蛋白质生物合成(20%)、代谢相关(40%)、防御应答(30%)和GA信号途径(10%),1个为功能未知蛋白。4个候选蛋白基因的RT-q PCR分析结果显示,茉莉酸诱导蛋白1和抗坏血酸过氧化物酶基因在mRNA水平的表达变化与蛋白水平一致,而赤霉素受体基因GID1L2和茉莉酸诱导蛋白2基因的表达可能与转录后调控有关。[结论]本文揭示了西瓜幼苗根系发育蛋白质组的表达特征,获得了在西瓜根系发育过程中可能有重要功能的蛋白,为深入开展西瓜根系生长发育相关基因功能研究提供了数据资源。

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