金边鲤皮肤黑色素合成及转运相关基因表达分析
Skin melanin synthesis of Jinbian carp and expression analysis of transport related genes作者机构:广西水产引育种中心南宁530031 柳州市水产技术推广站广西柳州545066 融水县水产技术推广站广西融水545300
出 版 物:《南方农业学报》 (Journal of Southern Agriculture)
年 卷 期:2020年第51卷第2期
页 面:453-460页
学科分类:090801[农学-水产养殖] 0908[农学-水产] 09[农学]
基 金:国家大宗淡水鱼产业技术体系建设专项(CARS-45)。
主 题:金边鲤 黑色素 差异表达基因 黑色素合成相关基因 心肌肾上腺素通路 色素沉着
摘 要:【目的】研究影响金边鲤皮肤色素沉着的关键基因及信号通路,揭示其皮肤颜色差异形成的原因,为金边鲤良种培育提供候选基因信息。【方法】基于突变型金边鲤黄色皮肤(Y组)和黑色皮肤(B组)及野生型金边鲤黑色皮肤(W组)的转录组测序数据,筛选分析获得部分共有差异表达基因,利用实时荧光定量PCR检测差异表达基因和黑色素合成相关基因的表达情况,并分析各基因间的相关性。【结果】依据转录组数据筛选获得ACT3、MYH2、TPM1、TPM2和TPM3共5个来源于心肌肾上腺素信号通路及与细胞动力相关的基因;除ACT3基因外,其余4个基因(MYH2、TPM1、TPM2和TPM3)在Y组皮肤中的相对表达量均显著低于B组和W组(PB组Y组,其中W组的相对表达量显著高于B组和Y组。相关性分析结果显示,MC-1R和TYR基因与ACT3、MYH2、TPM1、TPM2和TPM3基因呈显著或极显著(P0.05)。【结论】ACT3、MYH2、TPM1、TPM2和TPM3基因及其所在的心肌肾上腺素信号通路可能影响黑色素合成与运动,且与黑色素合成相关基因存在相关性,可作为金边鲤体色变异研究中的标记基因。