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苹果茎痘病毒基因变异及重组分析

Analysis of Variation and Recombination of Apple Stem Pitting Virus

作     者:李丽丽 杨洪一 来永才 LI Li-li;YANG Hong-yi;LAI Yong-cai

作者机构:黑龙江省林业科学研究所黑龙江哈尔滨150081 东北林业大学生命科学学院黑龙江哈尔滨150040 黑龙江省农业科学院耕作栽培研究所黑龙江哈尔滨150086 

出 版 物:《河南农业科学》 (Journal of Henan Agricultural Sciences)

年 卷 期:2014年第43卷第5期

页      面:102-105页

学科分类:0710[理学-生物学] 07[理学] 071007[理学-遗传学] 

基  金:中央高校基本科研业务费资助项目(DL13EA06-3) 

主  题:苹果茎痘病毒 变异 重组 RNA二级结构 

摘      要:苹果茎痘病毒(apple stem pitting virus,ASPV)是一种严重危害果树生产的潜隐性病毒,为了解ASPV的变异特点,基于已报道的ASPV外壳蛋白(coat protein,CP)基因核苷酸序列信息,结合RNA二级结构分析,对ASPV的变异进行分析。结果显示,不同分离物CP基因前半部分区域存在3个大段的空位区。中国分离物PR1在CP基因末端有12个核苷酸的序列插入,RNA二级结构预测显示,插入点附近能形成一个稳定的茎环结构,序列插入并未引起RNA二级结构的明显变化。重组分析显示,波兰分离物ST181为中国分离物WS和波兰分离物N1的重组体,系统进化分析支持该重组事件的发生。ASPV核苷酸序列变异复杂,并能够发生重组,因而有必要收集更多抗性资源,加强抗病育种。

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