16种微生物蛋白酶的生物信息学分析

作     者：富玉竹 李欣 李晔 王斯德 金丽华 于然 Fu Yuzhu

作者机构：北京电子科技职业学院生物工程学院北京100176 

出 版 物：《江苏农业科学》 (Jiangsu Agricultural Sciences)

年 卷 期：2020年第48卷第4期

页      面：65-65,66-72页

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 0828[工学-农业工程] 08[工学] 09[农学] 071007[理学-遗传学] 0901[农学-作物学] 0836[工学-生物工程] 090102[农学-作物遗传育种] 

基　　金：北京市自然科学基金(编号:2182019) 北京市教育委员会项目(编号:1-PXM2018-014306-000057/7) 国家自然科学基金青年科学基金(编号:51708005) 北京电子科技职业学院重点课题(编号:2019-KXZ) 北京市优秀人才资助(拔尖自然科学)(编号:2020Z002-002-KWT) 

主　　题：微生物 蛋白酶 序列分析 生物信息学 理化性质 蛋白结构 信号肽 

摘      要：蛋白酶(protease)是以降解蛋白质为主的糖苷酶,具有丰富的多样性,在生物有机体中发挥着重要而又广泛的作用,具有广泛的研究和应用价值。本研究采用ProtParam、ProtScale、SignalP 4.1 server和NPSA serve等生物信息学软件,对天蓝色链霉菌、普通拟杆菌、金黄色葡萄球菌、枯草杆菌等16种微生物蛋白酶的理化性质、蛋白结构、系统发生树和功能域等进行了分析。结果表明:通过分析16种微生物蛋白酶的稳定性发现,金黄色葡萄球菌、唾液链球菌、短小芽孢杆菌、绿脓杆菌为不稳定蛋白;二级结构由α螺旋、β转角、无规则卷曲和延伸链等结构元件组成;除了节杆菌属、无乳链霉菌、普通拟杆菌、肠杆菌属具有信号肽,其余蛋白酶氨基酸序列不具有信号肽的特点。可以推测出蛋白酶为非分泌性蛋白;只有绿脓杆菌和猪链球菌有跨膜结构,剩下其余几种微生物均没有跨膜结构。具有2个蛋白功能域,分别为Peptidase S8 familyi、Fn35like domain。