基于网络药理学和分子对接技术探讨自拟“清瘟汤”治疗新型冠状病毒肺炎的机制

作     者：马诗瑜 方洁 卞晓岚 杨铭 郑岚 郑林 MA Shiyu;FANG Jie;BIAN Xiaolan;YANG Ming;ZHENG Lan;ZHENG Lin

作者机构：上海交通大学医学院附属瑞金医院上海200023 上海中医药大学附属龙华医院上海200032 上海中医药大学附属光华医院上海200003 

出 版 物：《中国药业》 (China Pharmaceuticals)

年 卷 期：2020年第29卷第7期

页      面：1-9页

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 100506[医学-中医内科学] 1006[医学-中西医结合] 1005[医学-中医学] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

基　　金：上海交通大学医学院“临床药学创新研究院”重点专项建设项目[CXYJY2019MS004] 2020年度上海交通大学医学院新型冠状病毒感染肺炎抗疫相关药事管理与合理用药研究专项[JDYX2020KYZX010] 2020年度上海交通大学医学院新型冠状病毒感染肺炎抗疫相关药事管理与合理用药研究专项[JDYX2020KYZX011] 上海中医药大学附属龙华医院防治新型冠状病毒(COVID-19)应急科研攻关项目 

主　　题：新型冠状病毒 分子对接技术 清瘟汤 网络药理学 抗病毒 作用机制 

摘      要：目的利用中药网络药理学和分子对接技术,探讨清瘟汤作用靶标与新型冠状病毒(SARS-CoV-2)之间的关联以及多成分、多靶标的治疗机制。方法通过建立化学成分、靶点,筛选主要活性成分和靶标,用Cytoscape软件构建和分析网络,使用String对靶标进行GO及KEGG功能富集分析,采用Autodock软件对“清瘟汤(QWT)主要活性成分与SARS-CoV-2的3C类似蛋白酶(3CLpro)和血管紧张素转换酶2(ACE2)蛋白进行分子对接。结果QWT中共有172个活性成分涉及480个靶标,其中大多数中药归胃经、肺经和脾经,27个活性成分(琥珀酸、香豆素、γ-氨基丁酸、谷氨酰胺、槲皮素、山柰酚、脯氨酸、赖氨酸、木犀草素、色氨酸、L-缬氨酸、胆碱、芹菜素、β-谷固醇、苯丙氨酸、丙氨酸、水杨酸、DL-缬氨酸、羽扇豆酚、腺苷、谷氨酸、熊果酸、大黄素、异鼠李素、黄豆苷元、柠檬酸、阿魏酸)与靶标关系最密切;QWT关键靶点涉及CASP3,CYP1A1,JUN,TP53,HMOX1,ICAM1,FOS,PPARG,CXCR4,SRC,TYR,B2M,MMP9,RPS27A,PSMD3,NPEPPS,CNDP2,TNF,AKT1,APP,NPY1R,CTSS,PTGER3,GGCT,UBB,HLA-A,PTGS2,CXCL8,FUM,PSMC4等,重要靶标富集在感染性疾病、肺部疾病和免疫性疾病三大类疾病通路上,GO分类和KEGG通路富集主要调控抗炎、免疫、血管生成、钙通道等相关。分子对接结果显示,槲皮素、芹菜素、熊果酸、异鼠李素、羽扇豆酚与3CLpro和ACE2蛋白具有一定的亲和力。结论QWT中的活性化合物主要作用于CASP3,CYP1A1,JUN,TP53,HMOX1等靶点,其中有5种化合物可与SARS-CoV-2的2种主要蛋白进行分子对接,QWT总体通过调节多条信号通路,从而可能产生抗SARS-CoV-2作用。