用主成分分析探索基因表达模式

作     者：王成雄 饶妮妮 王玉 Wang Chengxiong;Rao Nini;Wang Yu

作者机构：电子科技大学生命科学与技术学院成都610054 

出 版 物：《生物医学工程学杂志》 (Journal of Biomedical Engineering)

年 卷 期：2007年第24卷第4期

页      面：736-741页

核心收录：

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 071007[理学-遗传学] 

基　　金：国家自然科学基金面上项目资助(60571047) 

主　　题：主成分分析 微阵列 基因表达谱 基因表达模式 

摘      要：以时间点(阵列)为变量,对酵母时间表达序列进行主成分分析,提取出三个主成分:第一主成分代表整个酵母细胞周期中平稳的基因表达状态,第二主成分代表酵母细胞周期中lateG1期和M期差异的基因表达状态,第三主成分表示的是earlyG1期和S/G2期差异的基因表达状态。由第二、和第三主成分揭示出基因表达谱中四个周期性基因表达模式:分别对应lateG1期、M期、earlyG1期和S/G2期,而且发现了一批表达水平呈周期性变化的基因,为进一步研究基因周期性表达和基因调控网络提供有价值的指导。