虎纹蛙肠道微生物结构与功能分析

作     者：刘文舒 陈彦良 郭小泽 唐艳强 肖海红 李思明 LIU Wenshu;CHEN Yanliang;GUO Xiaoze;TANG Yanqiang;XIAO Haihong;LI Siming

作者机构：江西省农业科学院畜牧兽医研究所 

出 版 物：《野生动物学报》 (CHINESE JOURNAL OF WILDLIFE)

年 卷 期：2020年第41卷第1期

页      面：171-181页

学科分类：0710[理学-生物学] 07[理学] 071005[理学-微生物学] 

基　　金：江西省重点研发计划项目(20192BBH80013) 江西省特种水产产业技术体系(JXARS-10) 江西现代农业科研协同创新专项(JXXTCXQN201903) 

主　　题：虎纹蛙 肠道 微生物 结构 功能 

摘      要：利用高通量测序方法对虎纹蛙前肠、中肠和后肠微生物结构和功能进行分析。结果表明,虎纹蛙(Rana rugulosa)肠道核心菌群是厚壁菌门(Firmicutes)、变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、梭杆菌门(Fusobacteria)和放线菌门(Actinobacteria)。Romboutsia属、鲸杆菌属(Cetobacterium)、叶杆菌属(Phyllobacterium)是绝对优势菌属。肠道中存在弧菌(Vibro)、邻单胞菌(Plesiomonas)、气单胞菌(Aeromonas)、爱德华氏菌(Edwardsiella)不动杆菌属(Acinetobacter)、黄杆菌属(Flavobacterium)、脱硫弧菌属(Desulfovibrio)、鞘脂单胞菌属(Sphingomonas)、伊丽莎白菌(Elizabethkingia)等常见的条件致病菌和芽孢杆菌(Bacillus)、乳酸杆菌(Lactobacillus)和双歧杆菌(Bifidobacterium)等潜在益生菌。比较发现,前肠和中肠微生物丰度和多样性显著高于后肠,且在门和属水平菌群结构差异明显;前肠和中肠微生物功能相似,与能量代谢、维生素代谢、氨基酸代谢、脂代谢、外源物质降解和代谢关联微生物丰度较高,而后肠中与核酸代谢、碳水化合物代谢关联微生物丰度较高。前肠和中肠中与信号转导、神经系统、内分泌系统、转运和分解等关联微生物丰度较高,后肠中与信号分子互作、细胞过程与信号、增殖与修复、免疫系统、翻译、转录、酶家族、环境适应、膜转运等关联微生物丰度较高。本研究解析了虎纹蛙肠道菌群结构和功能,为虎纹蛙健康养殖提供理论基础。