中药植物玉竹微卫星标记的筛选及遗传多样性分析

作     者：周珏 李暮淋 吴孝兵 高鹏 张梦函 时玲玲 陆颖 王晖 ZHOU Jue;LI Mu-lin;WU Xiao-bing;GAO Peng;ZHANG Meng-han;SHI Ling-ling;LU Ying;WANG Hui

作者机构：皖南医学院基础医学院病理教研室安徽芜湖241002 安徽师范大学基因疾病与健康生物医学安徽普通高校重点实验室安徽省重要生物资源保护与利用重点实验室安徽省中药日化产品工程技术研究中心安徽芜湖241000 

出 版 物：《佳木斯大学学报（自然科学版）》 (Journal of Jiamusi University：Natural Science Edition)

年 卷 期：2020年第38卷第1期

页      面：103-107页

学科分类：1008[医学-中药学(可授医学、理学学位)] 1006[医学-中西医结合] 100602[医学-中西医结合临床] 10[医学] 

基　　金：安徽省自然科学基金项目(1408085MC59) 安徽高校自然科学研究项目(KJ2018A0258,) 安徽高校自然科学研究项目(KJ2019A0422) 

主　　题：玉竹 药用植物 微卫星 遗传多样性 多态性 

摘      要：利用磁珠富集法构建玉竹的微卫星文库,用筛选出的微卫星引物对玉竹样品进行遗传多样性分析。根据链亲和素磁珠和生物素特异结合的特性,用3’端生物素标记的探针与两端连接已知序列人工接头的玉竹基因组DNA酶切片段杂交,杂交复合物结合到包被有链亲和素的磁珠上,洗脱并收集吸附在磁珠上的含有微卫星的片段。经过克隆和测序,再根据微卫星两侧的保守序列设计引物,最后利用从中筛选出的微卫星引物对玉竹种群进行遗传学分析。从基因组微卫星富集文库中分离出9个多态微卫星位点,来自3个玉竹种群的40个个体的多态性显示,每个位点的等位基因数从3到6个不等,观察杂合度范围为0000~0.875,预期杂合度范围为0.520~0.760,多态信息含量范围为0.066~0.687。9个多态位点经哈温平衡检测结果显示有5个位点符合哈迪-温伯格(Hardy-Weinberg)平衡,其余4个位点显著偏离哈温平衡(P0.05)。这可能是存在无效等位基因和或近亲繁殖效应的结果,鉴定出的微卫星遗传标记可以在玉竹的遗传多样性和种群遗传结构的评价中具有潜在的应用价值。