643例中国北方汉族急性淋巴细胞白血病患者人类白细胞抗原连锁不平衡分析
Analysis of HLA haplotype frequency and linkage disequilibrium in patients with acute lymphoblastic leukemia from Northern Chinese Han~作者机构:广东省深圳市血液中心研究所中华骨髓库深圳HLA分型实验室518035
出 版 物:《中华医学遗传学杂志》 (Chinese Journal of Medical Genetics)
年 卷 期:2009年第26卷第1期
页 面:82-86页
核心收录:
学科分类:1002[医学-临床医学] 100210[医学-外科学(含:普外、骨外、泌尿外、胸心外、神外、整形、烧伤、野战外)] 10[医学]
基 金:深圳市科技计划项目(200603202) 中华骨髓库合作项目 志谢 感谢中国造血干细胞捐献者资料库管理中心领导、专家和同仁对本项目的支持和帮助.感谢深圳市第二人民医院血液病研究所汪明春教授和李明主任的指导,感谢深圳大学超级计算中心、数学系李国教授、李飞鹏老师在编写计算机程序上和数学统计学方面的帮助
摘 要:目的分析643例中国北方汉族急性淋巴细胞白血病(acute lymphoblastic leukemia,ALL)患者组和20359名健康对照组的人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)HLA—AB、BDR和A—B-DR单倍型频率及连锁不平衡分布差异。方法应用最大似然性算法(expectation—maximization,EM)计算患者组和对照组的HLA-A-B、B—DRB1和A—B—DRB1单倍型频率及连锁不平衡参数,采用x^2检验比较其分布差异。结果HLA-A30-B13、A2-B46、A33-B58,B13-DR7、B46-DR9、B52-DR15、B58-DR17,A30-B13DR7、A33-B58-DR17和A1-B37-DR10单倍型是两组常见、共有呈强连锁不平衡单倍型。A30—B13、A2-B46、A33-B44、B13-DR7、A30-B13-DR7和A2-B46-DR9的单倍型频率和连锁不平衡水平,患者组低于对照组,差异有统计学意义(x^2〉3.84,P〈0.05)。A2-B52、A2-B27、A24-B8,B60-DR9、B27-DR4、B52-DR14、B44-DR17、B27-DR12、和A11-B27-DR12的单倍型频率和连锁不平衡水平,患者组高于对照组,差异有统计学意义(x^2〉3.84,P〈0.05)。结论643例北方汉族ALL患者组HLA-A-B、B-DRB1、A—B-DRB1单倍型频率分布及连锁不平衡遗传特征和对照组具有高度的同源性。患者组与对照组之间的部分HLA单倍型频率及连锁不平衡分布存在统计学差异。本研究结果为ALL与HLA疾病相关性及HLA相合供者的寻找提供了基础数据。