三维等离子体粒子模拟程序的数据模型和I/O性能改进
A Data Model and I /O Performance Improvement for 3-D Plasma Simulations with Particle作者机构:清华大学计算机科学与技术系高性能计算研究所北京100084 北京应用物理与计算数学研究所高性能计算中心北京100088
出 版 物:《计算机工程与应用》 (Computer Engineering and Applications)
年 卷 期:2004年第40卷第20期
页 面:104-107,110页
核心收录:
学科分类:08[工学] 0812[工学-计算机科学与技术(可授工学、理学学位)]
基 金:国家973基础研究发展计划项目(编号:G1999032805) 中物院预先研究项目(编号:42105) 科学技术基金(编号:20030654)
摘 要:文章围绕强激光与等离子体相互作用三维数值模拟程序LARED-P数据输出存在的问题,给出了基于HDF5格式的数据模型,通过将计算结果进行重新组织和管理,实现了数据的实时压缩存储和高性能并行I/O,获得了较好的空间存储效率和时间效率,同时,程序提供了灵活的数据搜索机制,能够在程序运行过程中提取数据子集,满足了可视化系统准实时读入数据的需求。