应用微阵列芯片分析结肠癌组织中miRNA差异性表达
Differential Expression of Colon Cancer MicroRNA in Microarry Study作者机构:四川大学华西医院胃肠外科器官微循环与消化外科研究室成都610041
出 版 物:《四川大学学报(医学版)》 (Journal of Sichuan University(Medical Sciences))
年 卷 期:2011年第42卷第3期
页 面:344-348页
核心收录:
学科分类:0710[理学-生物学] 1002[医学-临床医学] 100214[医学-肿瘤学] 10[医学]
基 金:国家自然科学基金(批准号30830100 30801332)资助
摘 要:目的分析结肠癌与正常结肠黏膜的微小RNA(miRNA)表达谱差异。方法收集结肠癌组织和癌旁正常结肠黏膜共12对,抽提、纯化RNA,加入荧光标记后与miRNA寡核甘酸基因芯片(Affymetrix公司)杂交,应用SAM软件进行数据分析,对有显著差异的miRNA进行实时荧光定量PCR验证,采用靶基因分析软件分析miRNA功能。结果 has-miR-182、has-miR-17、has-miR-106a、has-miR-93、has-miR-200c、has-miR-92a、has-let-7a、has-miR-20a等8个miRNA在肿瘤组织中显著上调〔中位假基因验出率(FDR)5%〕,has-miR-195、has-miR-143、has-miR-145等3个miRNA显著下调(FDR5%)。结论结肠癌与正常结肠黏膜之间存在明显的miRNA差异表达,这些miRNA的差异性表达可能与结肠癌的发病、侵袭、转移相关。